RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CTIF-205ENST00000587860 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
CTIF-205ENST00000587860 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.08■□□□□ 0.65
CTIF-205ENST00000587860 FCHSD2O94868 740 aa19.08■□□□□ 0.64
CTIF-205ENST00000587860 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.08■□□□□ 0.64
CTIF-205ENST00000587860 NFKBIBQ15653 356 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-205ENST00000587860 LNPKQ9C0E8 428 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-205ENST00000587860 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CTIF-205ENST00000587860 IL13P35225 146 aa19.06■□□□□ 0.64
CTIF-205ENST00000587860 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.06■□□□□ 0.64
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CTIF-205ENST00000587860 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.89■□□□□ 0.61
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CTIF-205ENST00000587860 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF853P0CG23 659 aa18.87■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 AMPHP49418 695 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 NLRP6P59044 892 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 PTPRUQ92729 1446 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
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CTIF-205ENST00000587860 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 NUCB1Q02818 461 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
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