RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cdc37l1	Q9CZP7	335 aa		28.48	■■■□□ 2.15
Nisch-222	ENSMUST00000172142		Q4VA45	678 aa		28.47	■■■□□ 2.15
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cdk19	Q8BWD8	501 aa		28.47	■■■□□ 2.15
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Atp2b2	Q9R0K7	1198 aa		28.46	■■■□□ 2.15
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Lifr	P42703	1092 aa		28.45	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Utp14a	Q640M1	767 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nek4	Q9Z1J2	792 aa		28.45	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Znf541	Q0GGX2	1363 aa		28.45	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nsd3	Q6P2L6	1439 aa		28.44	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ddit3	P35639	168 aa		28.44	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tbc1d9	Q3UYK3	1264 aa		28.44	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ankrd44	B2RXR6	993 aa		28.44	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Vamp4	O70480	141 aa		28.44	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Trim44	Q9QXA7	346 aa		28.44	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Adamtsl3	G3UXC7	1706 aa		28.43	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Senp3	Q9EP97	568 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Naip7	Q9JIB3	1402 aa		28.43	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ncapd2	Q8K2Z4	1392 aa		28.43	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Arhgap23	Q69ZH9	1483 aa		28.42	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Paxip1	Q6NZQ4	1056 aa		28.42	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cars	Q9ER72	831 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gnai1	B2RSH2	354 aa		28.41	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Slk	O54988	1233 aa		28.41	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gnai3	Q9DC51	354 aa		28.41	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Prrc2b	Q7TPM1	1486 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Birc3	O08863	600 aa		28.39	■■■□□ 2.14
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Atp7b	Q64446	1462 aa		28.39	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cgnl1	Q6AW69	1298 aa		28.38	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Kdm4c	Q8VCD7	1054 aa		28.38	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142		Q9D9H8	365 aa		28.38	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Trim28	Q62318	834 aa		28.38	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Adamts7	Q68SA9	1657 aa		28.36	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Hnrnpu	Q8VEK3	800 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Taok2	Q6ZQ29	1240 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ccdc146	E9Q9F7	977 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Casq1	O09165	405 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Trim27	Q62158	513 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cep170b	Q80U49	1574 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Eif4g2	Q62448	906 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Usp16	Q99LG0	825 aa		28.33	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rictor	Q6QI06	1708 aa		28.33	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	1700010I14Rik	Q7TPG0	532 aa		28.33	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ercc6l2	Q9JIM3	1537 aa		28.33	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Kif13a	Q9EQW7	1749 aa		28.33	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	U2surp	Q6NV83	1029 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ppp1r15a	P17564	657 aa		28.32	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rrp12	Q6P5B0	1295 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Safb2	Q80YR5	991 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ahdc1	Q6PAL7	1594 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Vsig10	D3YX43	558 aa		28.31	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Usp32	F8VPZ3	1604 aa		28.29	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ric3	Q8BPM6	367 aa		28.28	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Dmrtc1	Q9D9R7	182 aa		28.27	■■■□□ 2.12
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cenpp	Q9CZ92	286 aa		28.26	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Aldh8a1	Q8BH00	487 aa		28.26	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Anapc15-ps	A0A140T8L6	141 aa		28.25	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cabp2	Q9JLK4	216 aa		28.25	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gcc1	Q9D4H2	778 aa		28.25	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cavin2	Q63918	418 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ppip5k2	Q6ZQB6	1129 aa		28.24	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ptprm	P28828	1452 aa		28.23	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Bag4	Q8CI61	457 aa		28.23	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zfp777	B9EKF4	885 aa		28.22	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Triml2	E9PW10	424 aa		28.22	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mcm2	P97310	904 aa		28.22	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ddrgk1	Q80WW9	315 aa		28.22	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Bloc1s4	Q8VED2	215 aa		28.22	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Map3k19	E9Q3S4	1311 aa		28.21	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Sos1	Q62245	1319 aa		28.21	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Plin1	Q8CGN5	517 aa		28.21	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rab11fip3	Q8CHD8	1047 aa		28.21	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mcm10	Q0VBD2	885 aa		28.2	■■■□□ 2.11
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Fancl	Q9CR14	375 aa		28.19	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Arhgef28	P97433	1693 aa		28.19	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Stk11ip	Q3TAA7	1072 aa		28.19	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Itsn1	Q9Z0R4	1714 aa		28.18	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Znf316	Q6PGE4	1016 aa		28.18	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tmx3	Q8BXZ1	456 aa		28.18	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zkscan1	Q8BGS3	561 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mars	Q68FL6	902 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Engase	Q8BX80	734 aa		28.17	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Uhrf1bp1l	A2RSJ4	1457 aa		28.16	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Asxl2	Q8BZ32	1370 aa		28.16	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Klhdc4	Q921I2	584 aa		28.16	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ngef	Q8CHT1	710 aa		28.15	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mycl	P10166	368 aa		28.15	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Plekhg1	F6S200	1446 aa		28.14	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ptma	P26350	111 aa		28.14	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rsph6a	Q8CDR2	708 aa		28.14	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Aldh1l2	Q8K009	923 aa		28.14	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ppp6r3	Q922D4	844 aa		28.14	■■■□□ 2.1
Nisch-222	ENSMUST00000172142	1700019A02Rik	A0A087WPV9	146 aa		28.14	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mlec	Q6ZQI3	291 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rasa1	E9PYG6	1038 aa		28.13	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nucb1	Q02819	459 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pdia3	P27773	505 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Fam13a	Q8BGI4	693 aa		28.12	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Dmtn	Q9WV69	405 aa		28.12	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nktr	P30415	1453 aa		28.12	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Abca14	E9Q8F8	1683 aa		28.12	■■■□□ 2.09

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