RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	RTS1	P38903	757 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	VHR2	P40041	505 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	KIN1	P13185	1064 aa		5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	ADP1	P25371	1049 aa		5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
FMP46	YKR049C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
FMP46	YKR049C	HXT13	P39924	564 aa		5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	YIL089W	P40500	205 aa		5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	HXT17	P53631	564 aa		5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	YPL260W	Q08977	551 aa		5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	CSR2	Q12734	1121 aa		5	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	DMA1	P38823	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SPO22	P40511	975 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	YIR014W	P40570	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	RAD61	Q99359	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	MPH3	P0CE00	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	PRE8	P23639	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	YBL028C	P38202	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	YHL050C	P38721	697 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	PES4	P39684	611 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	FLO1	P32768	1537 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	SRM1	P21827	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	PEP3	P27801	918 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	RER2	P35196	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	MYO3	P36006	1272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	VID27	P40157	782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	UFD2	P54860	961 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FMP46	YKR049C	ANP1	P32629	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
FMP46	YKR049C	CST26	P38226	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PNT1	P38969	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ECM23	Q02710	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ERG12	P07277	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
FMP46	YKR049C	IMP2'	P32351	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	BSD2	P38356	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	VPS8	P39702	1274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	EST2	Q06163	884 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	MAK31	P23059	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RIT1	P23796	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	OPY1	P38271	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ACA1	P39970	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ALG2	P43636	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	HDA1	P53973	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	CHS3	P29465	1165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	FBP26	P32604	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	OCT1	P35999	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	SIS2	P36024	562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	SOL4	P53315	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	FOL1	P53848	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	CST9	Q06032	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	TFC6	Q06339	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	LAP2	Q10740	671 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	NUC1	P08466	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PER1	P25625	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	MAL31	P38156	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RSC30	P38781	883 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	VAB2	P40003	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	LYS14	P40971	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	NET1	P47035	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	YKE2	P52553	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RBA50	Q04418	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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