RNA–Protein interactions for RNA: YHR109W

CTM1, Transcript of Cytochrome c lysine methyltransferase, yeast

Gene CTM1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTM1	YHR109W	TIM23	P32897	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	DUR3	P33413	735 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	MNN1	P39106	762 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	CLA4	P48562	842 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	YGR053C	P53234	283 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	CCP1	P00431	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	ISW1	P38144	1129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	GIP1	P38229	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	JJJ2	P46997	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	YJR115W	P47152	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	TYW3	P53177	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	ADI1	Q03677	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	VRP1	P37370	817 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	AIM46	P38885	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	YJL171C	P46992	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	YJR142W	P47173	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	PPM2	Q08282	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	TOM20	P35180	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	RGA1	P39083	1007 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	YTA6	P40328	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	NUT1	P53114	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	RTS3	P53289	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	UBX5	Q06682	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	MRL1	Q06815	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	MET32	Q12041	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	RPC31	P17890	251 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	IRE1	P32361	1115 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	XKS1	P42826	600 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	HED1	Q03937	162 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CTM1	YHR109W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	EEB1	Q02891	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	FLC1	Q08967	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	PHO8	P11491	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	UGA3	P26370	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YBR184W	P38299	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	DLD1	P32891	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	STE5	P32917	917 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	RSM26	P47141	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	ESC2	Q06340	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	PSH1	Q12161	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	GRX4	P32642	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	SQT1	P35184	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YBR287W	P38355	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	AAD14	P42884	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	MSN5	P52918	1224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	THI4	P32318	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	SLA1	P32790	1244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	ITC1	P53125	1264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	PEX13	P80667	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	TOP1	P04786	769 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YIL165C	P40446	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YNR040W	P53736	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	ARG82	P07250	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	PEX28	P38848	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CTM1	YHR109W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	RAD27	P26793	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	GNP1	P48813	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	DNM1	P54861	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTM1	YHR109W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SRM1	P21827	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	SEA4	P38164	1038 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	YEN1	P40028	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	HDA2	Q06629	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	REC8	Q12188	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTM1	YHR109W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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