RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A FIR1P40020 876 aa6.07□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A BIO5P53744 561 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A POL5P39985 1022 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A EMG1Q06287 252 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A PUN1Q06991 263 aa6.06□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A SOG2Q08817 791 aa6.05□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A AIM46P38885 310 aa6.04□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A NCE103P53615 221 aa6.04□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A TFA2P36145 328 aa6.03□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A ALD3P54114 506 aa6.03□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A SPO71Q03868 1245 aa6.03□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A RNQ1P25367 405 aa6.02□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A SDH1Q00711 640 aa6.02□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A PUF6Q04373 656 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A ELG1Q12050 791 aa6.02□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A HXT8P40886 569 aa6.01□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A FUS1P11710 512 aa6□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A YCR015CP25616 317 aa6□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A CPS1P27614 576 aa6□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A NEO1P40527 1151 aa6□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A GIC2Q06648 383 aa6□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A SEG2P34250 1132 aa5.99□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A SEA4P38164 1038 aa5.99□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A SRS2P12954 1174 aa5.98□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A ERS1P17261 260 aa5.98□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A PUP1P25043 261 aa5.98□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A LRG1P35688 1017 aa5.97□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A RGD2P43556 714 aa5.97□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A YNR065CP53751 1116 aa5.97□□□□□ -1.45
YHL009W-AYHL009W-A BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A YJR124CP47159 448 aa5.96□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A GIS1Q03833 894 aa5.95□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A NIT1P40447 199 aa5.94□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A FAR11P53917 953 aa5.94□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A NTA1P40354 457 aa5.93□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A ECL1P48235 211 aa5.93□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A HAS1Q03532 505 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A NSI1Q12457 570 aa5.93□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A RRN6P32786 894 aa5.92□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A YKL222CP35995 705 aa5.92□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A MMM1P41800 426 aa5.92□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A DFG16Q99234 619 aa5.92□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A RAD55P38953 406 aa5.91□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A YMR074CQ04773 145 aa5.91□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A GLO4Q12320 285 aa5.91□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A FET4P40988 552 aa5.9□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A CWC15Q03772 175 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A YOR223WQ12015 292 aa5.9□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
YHL009W-AYHL009W-A HVG1P0CE11 249 aa5.89□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A CIT3P43635 486 aa5.89□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A PNP1Q05788 311 aa5.89□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A KTR2P33550 425 aa5.88□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A IRS4P36115 615 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A GPT2P36148 743 aa5.88□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A PSY2P40164 858 aa5.88□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A PRP43P53131 767 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A APC11Q12157 165 aa5.88□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A PYC2P32327 1180 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A SMC1P32908 1225 aa5.86□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A RCM1P53972 490 aa5.86□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A YML083CQ04526 418 aa5.86□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A ESC8Q08119 714 aa5.86□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A YHL008CP38750 627 aa5.85□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A RPB10P22139 70 aa5.84□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A HSP78P33416 811 aa5.84□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A DMA2P53924 522 aa5.84□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A DOT1Q04089 582 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A YLL054CQ12244 843 aa5.84□□□□□ -1.47
YHL009W-AYHL009W-A LSO1Q3E827 93 aa5.81□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A FUR4P05316 633 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A SSA4P22202 642 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A LEO1P38439 464 aa5.8□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A TAF1P46677 1066 aa5.8□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A NOB1Q08444 459 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A OYE3P41816 400 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A CDA2Q06703 312 aa5.79□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A ADP1P25371 1049 aa5.78□□□□□ -1.48
YHL009W-AYHL009W-A RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A GIP4P39732 760 aa5.77□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A GCV1P48015 400 aa5.77□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A CTR9P89105 1077 aa5.76□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A TSA1P34760 196 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A ECM2P38241 364 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A YIG1Q08956 461 aa5.75□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A HTS1P07263 546 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A SSY1Q03770 852 aa5.74□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A TRE1Q08919 783 aa5.74□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A NPR1P22211 790 aa5.73□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A MEC3Q02574 474 aa5.73□□□□□ -1.49
YHL009W-AYHL009W-A ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
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