RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W AFT1P22149 690 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W ASH1P34233 588 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W ENP1P38333 483 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W RGA1P39083 1007 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W PSY2P40164 858 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W ALD6P54115 500 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W VPS16Q03308 798 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W PIN2Q12057 282 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W ULS1Q08562 1619 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W TSC11P40061 1430 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W RPS31P05759 152 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W CYC8P14922 966 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W IRE1P32361 1115 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W ISW1P38144 1129 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W MTO1P53070 669 aa7.2□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W GIP1P38229 639 aa7.19□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W VAC8P39968 578 aa7.19□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W INP54Q08227 384 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W HXK1P04806 485 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W RAD2P07276 1031 aa7.18□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W PET112P33893 541 aa7.18□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W YHL008CP38750 627 aa7.18□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W ALD3P54114 506 aa7.18□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W YOR296WQ08748 1289 aa7.18□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W SRF1Q12516 437 aa7.18□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W RPC31P17890 251 aa7.17□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W MNR2P35724 969 aa7.17□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W BSD2P38356 321 aa7.17□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W AIR1P40507 360 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W DAL4Q04895 635 aa7.17□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W TOS4Q06266 489 aa7.17□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W DAL1P32375 460 aa7.16□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W FAA3P39002 694 aa7.16□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W YCS4Q06156 1176 aa7.16□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W YOL098CQ12496 1037 aa7.16□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W FLP1P03870 423 aa7.15□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W PDC6P26263 563 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W SLA1P32790 1244 aa7.15□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W DLD1P32891 587 aa7.15□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W VTC4P47075 721 aa7.15□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W RGA2Q06407 1009 aa7.15□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W TY1A-DR3Q12441 440 aa7.15□□□□□ -1.26
VHS1YDR247W TY1B-HO13535 1793 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-JR1P47098 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-ER1Q03612 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-GR2Q12269 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-OLQ12273 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY3B-GQ99315 1547 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W LEU1P07264 779 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W PRP40P33203 583 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W AIM46P38885 310 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W MRPS18P42847 217 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W CWC24P53769 259 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W MCD1Q12158 566 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W PSH1Q12161 406 aa7.14□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TRK1P12685 1235 aa7.13□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W KAR2P16474 682 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W ECM2P38241 364 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-BRQ12193 1756 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-GR3Q12316 1755 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W TY1B-ORQ92393 1755 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W PRE9P23638 258 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data7.11□□□□□ -1.27not detected
VHS1YDR247W NUP85P46673 744 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W YJR098CP47139 656 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W YJR115WP47152 169 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W LSC2P53312 427 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W SPT7P35177 1332 aa7.11□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W YJL049WP47048 450 aa7.1□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W VPS15P22219 1454 aa7.1□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W PDR10P51533 1564 aa7.09□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W SKP1P52286 194 aa7.09□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W YPL109CQ02981 657 aa7.09□□□□□ -1.27
VHS1YDR247W VTH1P40438 1549 aa7.09□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W VTH2P40890 1549 aa7.09□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W RGP1P16664 663 aa7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W MCM5P29496 775 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W BRN1P38170 754 aa7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W CTR9P89105 1077 aa7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W YBT1P32386 1661 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.3 ms