RNA–Protein interactions for RNA: YAL016W

TPD3, Transcript of Regulatory subunit A of the heterotrimeric PP2A complex, yeast

Gene TPD3, Length 1,908 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPD3	YAL016W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TPD3	YAL016W	MON1	P53129	644 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPD3	YAL016W	TYW3	P53177	273 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPD3	YAL016W	ULP1	Q02724	621 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPD3	YAL016W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPD3	YAL016W	GCR1	P07261	785 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
TPD3	YAL016W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	CTR9	P89105	1077 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	COB	P00163	385 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	CCP1	P00431	361 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	YJR115W	P47152	169 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	ADI1	Q03677	179 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	PHO8	P11491	566 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	BAS1	P22035	811 aa		5	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	ISW1	P38144	1129 aa		5	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	KAP122	P32767	1081 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	DUR3	P33413	735 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	GIP1	P38229	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	SSN3	P39073	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	EEB1	Q02891	456 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	FLC1	Q08967	793 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	JJJ2	P46997	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	MRL1	Q06815	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	RPC31	P17890	251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	STE5	P32917	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	YBR184W	P38299	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	AIM46	P38885	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	XKS1	P42826	600 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	NUT1	P53114	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	THI4	P32318	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	UBP12	P39538	1254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	YTA6	P40328	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPD3	YAL016W	YEN1	P40028	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RSM26	P47141	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	GNP1	P48813	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	YGL081W	P53156	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	DNM1	P54861	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	ESC2	Q06340	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SRM1	P21827	482 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	YBR287W	P38355	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RGA1	P39083	1007 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
TPD3	YAL016W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	IRE1	P32361	1115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SWE1	P32944	819 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SQT1	P35184	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	VRP1	P37370	817 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	MSN5	P52918	1224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	CAN1	P04817	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	GAL11	P19659	1081 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SEA4	P38164	1038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	HED1	Q03937	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	HDA2	Q06629	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	SPO75	Q07798	868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	MET32	Q12041	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	PSH1	Q12161	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	RAD27	P26793	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	PEX28	P38848	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	YIL165C	P40446	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	ITC1	P53125	1264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	FMP25	Q08023	583 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	CIT1	P00890	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	VBA5	P36172	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPD3	YAL016W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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