RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496507.1

RPS29P11-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P11, Length 171 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P11-201ENST00000496507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RPS29P11-201ENST00000496507 TRIM47Q96LD4 638 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS29P11-201ENST00000496507 WDR70Q9NW82 654 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS29P11-201ENST00000496507 TNIKQ9UKE5 1360 aa3.09□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 WNT7AO00755 349 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 P3H3Q8IVL6 736 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 PXYLP1Q8TE99 480 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 CLIP1P30622 1438 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 KDM5BQ9UGL1 1544 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 TIAM1Q13009 1591 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 J3QL48 77 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SENP2Q9HC62 589 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 PRDM9Q9NQV7 894 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ATP10BO94823 1461 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 HECW1Q76N89 1606 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 MAPKBP1O60336 1514 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 TSPOAP1O95153 1857 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 OATP04181 439 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 GMPRP36959 345 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 FUT2Q10981 343 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 BRICD5Q6PL45 260 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 HPS1Q92902 700 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 FYCO1Q9BQS8 1478 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 PREX2Q70Z35 1606 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ABCA9Q8IUA7 1624 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ABCC10Q5T3U5 1492 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 VPS8Q8N3P4 1428 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 NUTM2FA1L443 756 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ARID3CA6NKF2 412 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 FCHSD2O94868 740 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ATP6V1AP38606 617 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 MSS51Q4VC12 460 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 MRGPRX2Q96LB1 330 aa3.05□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 UACAQ9BZF9 1416 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 GCGRP47871 477 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 MMP16P51512 607 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 TRIM32Q13049 653 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 RSPH4AQ5TD94 716 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 KIFC2Q96AC6 838 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 CROCC2H7BZ55 1655 aa3.04□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 PTPRGP23470 1445 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ASXL2Q76L83 1435 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 RICTORQ6R327 1708 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 FAM181BA6NEQ2 426 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 UBTFP17480 764 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 SKOR1P84550 965 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 ITSN2Q9NZM3 1697 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 KDM6BO15054 1643 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa3.03□□□□□ -1.92
RPS29P11-201ENST00000496507 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa3.03□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 WDR7Q9Y4E6 1490 aa3.03□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 ADGBQ8N7X0 1667 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 ERBB4Q15303 1308 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 H3BM21 787 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 FECHP22830 423 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 GSK3AP49840 483 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 TRIM46Q7Z4K8 759 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 NPAS3Q8IXF0 933 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 RDH13Q8NBN7 331 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 SLC16A10Q8TF71 515 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 NLRP7Q8WX94 980 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 GLI2P10070 1586 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.02□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 PHLDB1Q86UU1 1377 aa3.01□□□□□ -1.93
RPS29P11-201ENST00000496507 ABCA6Q8N139 1617 aa3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms