RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-201ENST00000372616 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 FLIIQ13045 1269 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 AGLP35573 1532 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 E9PCH4 1651 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 HIC1Q14526 733 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 NECTIN2Q92692 538 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 TRAK2O60296 914 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 CEP152O94986 1710 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 TRPM2O94759 1503 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 FCHSD2O94868 740 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 PDE3BQ13370 1112 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 GGT6Q6P531 493 aa9.46□□□□□ -0.89
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC3O15438 1527 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRTO14522 1441 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 POM121Q96HA1 1249 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.46□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 INSRP06213 1382 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 TIE1P35590 1138 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 KIF3CO14782 793 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 PTGDRQ13258 359 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC184Q52MB2 194 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2R1Q13018 1463 aa9.44□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP7Q8WX94 980 aa9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 STAC3Q96MF2 364 aa9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 PHOX2BQ99453 314 aa9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 MCM6Q14566 821 aa9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 RALBP1Q15311 655 aa9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 GOPCQ9HD26 462 aa9.43□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 FAM161AQ3B820 660 aa9.42□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.42□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 TMC1Q8TDI8 760 aa9.42□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.42□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 KIF1BO60333 1816 aa9.42□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 NEFMP07197 916 aa9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 NPATQ14207 1427 aa9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 A6NJR5 290 aa9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.41□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 CLTCL1P53675 1640 aa9.4□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 BACH2Q9BYV9 841 aa9.4□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 USP47Q96K76 1375 aa9.4□□□□□ -0.9
CTPS1-201ENST00000372616 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.4□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 EVI5O60447 810 aa9.39□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 OXER1Q8TDS5 423 aa9.39□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 NOS1P29475 1434 aa9.39□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.38□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.38□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.38□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 PTGER2P43116 358 aa9.38□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.38□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 MROH2AA6NES4 1674 aa9.37□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3C2BO00750 1634 aa9.37□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.37□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.37□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.37□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.36□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.36□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.35□□□□□ -0.91
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