RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.89■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.89■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 FSD2A1L4K1 749 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 GGT6Q6P531 493 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 ABCC3O15438 1527 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 SMC5Q8IY18 1101 aa24.85■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 A0A1W2PP64 1363 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX2-201ENST00000306732 PANK2Q9BZ23 570 aa24.83■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 ABCC11Q96J66 1382 aa24.82■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 TRAK2O60296 914 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 HSCBQ8IWL3 235 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 NEO1Q92859 1461 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 RIPK4P57078 832 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 IL16Q14005 1332 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX2-201ENST00000306732 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 DIP2BQ9P265 1576 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 NUCB1Q02818 461 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 PIK3C2BO00750 1634 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 TSPOAP1O95153 1857 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 LNPKQ9C0E8 428 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 KIF16BQ96L93 1317 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 RAPGEF3O95398 923 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 DDIT3P35638 169 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 FYB1O15117 783 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 STK26Q9P289 416 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.7■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.7■■□□□ 1.55
PITX2-201ENST00000306732 SNX21Q969T3 373 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 MRE11P49959 708 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 RICTORQ6R327 1708 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 MED14O60244 1454 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 KIF2CQ99661 725 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX2-201ENST00000306732 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 PTPRMP28827 1452 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 CLCN1P35523 988 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 IDI1Q13907 227 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 PRAM1Q96QH2 718 aa24.61■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 PRKAR2BP31323 418 aa24.6■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 FCHSD2O94868 740 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 ZFYVE9O95405 1425 aa24.59■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 FBLN1P23142 703 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.58■■□□□ 1.53
PITX2-201ENST00000306732 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.58■■□□□ 1.52
PITX2-201ENST00000306732 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.57■■□□□ 1.52
PITX2-201ENST00000306732 GCC1Q96CN9 775 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms