RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 FAM177BA6PVY3 158 aa21.55■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.55■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 FIBPO43427 364 aa21.54■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 KDM5CP41229 1560 aa21.54■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 ERBB4Q15303 1308 aa21.54■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.53■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 CBX1P83916 185 aa21.53■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.53■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 PHF14O94880 888 aa21.53■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF521Q96K83 1311 aa21.52■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.52■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 SYNJ2O15056 1496 aa21.52■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF428Q96B54 188 aa21.52■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 KIF14Q15058 1648 aa21.52■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SIRT1-201ENST00000212015 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.51■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 TSPY26PQ9H489 355 aa21.51■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 GNAI1P63096 354 aa21.51■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.51■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.51■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 STK31Q9BXU1 1019 aa21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 FSD2A1L4K1 749 aa21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 DTNBO60941 627 aa21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 NUCB1Q02818 461 aa21.5■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.49■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 A2MP01023 1474 aa21.49■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 FBXW7Q969H0 707 aa21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 WDR62O43379 1518 aa21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 MAP7D2Q96T17 732 aa21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 CABP1Q9NZU7 370 aa21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 USP25Q9UHP3 1055 aa21.48■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.47■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 TSC1Q92574 1164 aa21.47■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.46■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 IGSF3O75054 1194 aa21.46■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.46■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 SMC5Q8IY18 1101 aa21.46■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 RBSNQ9H1K0 784 aa21.46■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 SAMD9Q5K651 1589 aa21.46■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 PKP1Q13835 747 aa21.45■■□□□ 1.03
SIRT1-201ENST00000212015 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 NPHP1O15259 732 aa21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 PRAM1Q96QH2 718 aa21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 DISP1Q96F81 1524 aa21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 MBD3O95983 291 aa21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 IFT57Q9NWB7 429 aa21.44■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 FAM83GA6ND36 823 aa21.44■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.44■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.44■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 TSPYL6Q8N831 410 aa21.44■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 ATP10BO94823 1461 aa21.43■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.43■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 STAC3Q96MF2 364 aa21.43■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 ERC2O15083 957 aa21.42■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 OFD1O75665 1012 aa21.42■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.42■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 FOSBP53539 338 aa21.42■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.42■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 SLC4A2P04920 1241 aa21.41■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.41■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 SNX21Q969T3 373 aa21.41■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.41■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.41■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 ADAMTS12P58397 1594 aa21.41■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.4■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.4■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 PIK3C2GO75747 1445 aa21.4■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 COG3Q96JB2 828 aa21.4■■□□□ 1.02
SIRT1-201ENST00000212015 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms