RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C HAT1Q12341 374 aa5.78□□□□□ -1.48
BRX1YOL077C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa5.78□□□□□ -1.48
BRX1YOL077C GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C NCL1P38205 684 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C FIR1P40020 876 aa5.76□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C SYT1Q06836 1226 aa5.76□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C DPH6Q12429 685 aa5.76□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C LSO1Q3E827 93 aa5.76□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C RPC31P17890 251 aa5.75□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C HXT8P40886 569 aa5.75□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C SKP1P52286 194 aa5.75□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C ISW1P38144 1129 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C GIP1P38229 639 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C YBR287WP38355 427 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C APM2P38700 605 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C QDR1P40475 563 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C JJJ3P47138 172 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C ATG1P53104 897 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C YOR296WQ08748 1289 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C YBL113CQ7M4S9 792 aa5.74□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C HEH2Q03281 663 aa5.73□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C APC11Q12157 165 aa5.73□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C RPB10P22139 70 aa5.72□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C GRS1P38088 690 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
BRX1YOL077C MSN1P22148 382 aa5.71□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C TRK2P28584 889 aa5.71□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C SMC1P32908 1225 aa5.71□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C BSD2P38356 321 aa5.71□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C ERP5P38819 212 aa5.71□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C ACF4P47129 309 aa5.7□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C RAD55P38953 406 aa5.69□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C ITC1P53125 1264 aa5.69□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C UFD2P54860 961 aa5.69□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C TRL1P09880 827 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C MSC7P38694 644 aa5.68□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C YNR040WP53736 256 aa5.68□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data5.67□□□□□ -1.5not detected
BRX1YOL077C KTR2P33550 425 aa5.67□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C AIM46P38885 310 aa5.66□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C NTA1P40354 457 aa5.66□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C MDJ2P42834 146 aa5.66□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C TRS120Q04183 1289 aa5.66□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C RSC2Q06488 889 aa5.66□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C AI1P03875 834 aa5.65□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C PDC5P16467 563 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C YIL165CP40446 119 aa5.65□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C RGD2P43556 714 aa5.65□□□□□ -1.5
BRX1YOL077C IDI1P15496 288 aa5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C SLD2P34252 453 aa5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C IRS4P36115 615 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C YHL050CP38721 697 aa5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C YHR219WP38900 624 aa5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C STM1P39015 273 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C PRK1P40494 810 aa5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C PSY2P40164 858 aa5.63□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C YML020WQ03722 664 aa5.63□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C MET1P36150 593 aa5.62□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C YJL181WP46987 611 aa5.62□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C PPT1P53043 513 aa5.62□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C YNR014WP53719 212 aa5.62□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C NUT2Q06213 157 aa5.62□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C THI72Q08579 599 aa5.61□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C FRT1Q99332 602 aa5.61□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C SEC20P28791 383 aa5.6□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C YNL011CP53980 444 aa5.6□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C ECM2P38241 364 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C THI12P42883 340 aa5.59□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C THI5P43534 340 aa5.59□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C THI11P47183 340 aa5.59□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C NSG2P53898 299 aa5.59□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C BSC2Q05611 235 aa5.59□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C THI13Q07748 340 aa5.59□□□□□ -1.51
BRX1YOL077C PGM2P37012 569 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C ALG14P38242 237 aa5.58□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C BOI2P39969 1040 aa5.58□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C CDC55Q00362 526 aa5.58□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C RSC4Q02206 625 aa5.58□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C PPX1P38698 397 aa5.57□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C SBE2P42223 864 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C NHA1Q99271 985 aa5.57□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C MRP10O75012 95 aa5.56□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C FUS1P11710 512 aa5.56□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C INP51P40559 946 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C SAM37P50110 327 aa5.56□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C GIS4Q04233 774 aa5.56□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C MNL2Q12205 849 aa5.56□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C MDJ1P35191 511 aa5.55□□□□□ -1.52
BRX1YOL077C YHL008CP38750 627 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms