RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	YMR187C	Q03236	431 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	TRS33	Q99394	268 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	MRP10	O75012	95 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	YBR197C	P38306	217 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	PRK1	P40494	810 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YKL063C	YKL063C	RPC31	P17890	251 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	VMA3	P25515	160 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	CWH41	P53008	833 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	PUN1	Q06991	263 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	MRPL33	P20084	86 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	ISC10	P32645	267 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	BSD2	P38356	321 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	PRY1	P47032	299 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	SKP1	P52286	194 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	MCA1	Q08601	432 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	YDR215C	Q12240	137 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	APM2	P38700	605 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	SKN7	P38889	622 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	ITC1	P53125	1264 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	ALG14	P38242	237 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	HEH2	Q03281	663 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	IDI1	P15496	288 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	MET1	P36150	593 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YKL063C	YKL063C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	GAS5	Q08193	484 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	LDH1	P38139	375 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	DYS1	P38791	387 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	YJL181W	P46987	611 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	GIS4	Q04233	774 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	SRS2	P12954	1174 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	MSN1	P22148	382 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	KTR2	P33550	425 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	TAT1	P38085	619 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	GIP1	P38229	639 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	PNP1	Q05788	311 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	NHA1	Q99271	985 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	RPB10	P22139	70 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YKL063C	YKL063C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	BUD9	P53226	547 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	RRM3	P38766	723 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	BOL3	P39724	118 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	TED1	P40533	473 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	LSB6	P42951	607 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	ISW1	P38144	1129 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	PPT1	P53043	513 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	RLF2	Q12495	606 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	YIL165C	P40446	119 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	HXT8	P40886	569 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	RGD2	P43556	714 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	YPL034W	Q03083	165 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YKL063C	YKL063C	RRN6	P32786	894 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	GIP2	P40036	548 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	TFA2	P36145	328 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.51	□□□□□ -1.53	RIP-Chip
YKL063C	YKL063C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	AIM46	P38885	310 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	FIR1	P40020	876 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	APC11	Q12157	165 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	AI3	P03877	415 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	LSO1	Q3E827	93 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	SAC7	P17121	654 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	RAD55	P38953	406 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	ALD3	P54114	506 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKL063C	YKL063C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	PAN5	P38787	379 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	KAR5	Q04746	504 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	RSC2	Q06488	889 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	PSY2	P40164	858 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	NTA1	P40354	457 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YKL063C	YKL063C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54

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