RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W ALD6P54115 500 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YOR131CQ12486 218 aa8.42□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W POL1P13382 1468 aa8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W KAR1P11927 433 aa8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W UBX7P38349 436 aa8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W RPT2P40327 437 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W RPN4Q03465 531 aa8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W NSE3Q05541 303 aa8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W CDC73Q06697 393 aa8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W YPR015CQ12531 247 aa8.41□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W BUD3P25558 1636 aa8.4□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W PDR12Q02785 1511 aa8.4□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W GAL2P13181 574 aa8.4□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data8.4□□□□□ -1.06not detected
YHC3YJL059W RDS2P19541 446 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W KTR7P40504 517 aa8.4□□□□□ -1.06
YHC3YJL059W VMA4P22203 233 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W BOI2P39969 1040 aa8.39□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W RTT106P40161 455 aa8.39□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W MCM16Q12262 181 aa8.39□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W MFT1P33441 392 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W MNL2Q12205 849 aa8.38□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W TRM1P15565 570 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W MNN1P39106 762 aa8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W NOC2P39744 710 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W ATG1P53104 897 aa8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W PUS6P53294 404 aa8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W ENV9Q08651 330 aa8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W HIF1Q12373 385 aa8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W RAD2P07276 1031 aa8.35□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W VPS27P40343 622 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W SAS4Q04003 481 aa8.35□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W RAS1P01119 309 aa8.34□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W MET6P05694 767 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W CLN2P20438 545 aa8.34□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data8.34□□□□□ -1.07not detected
YHC3YJL059W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W GYP1Q08484 637 aa8.34□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHC3YJL059W DPB3P27344 201 aa8.33□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W VPS16Q03308 798 aa8.33□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W PIN2Q12057 282 aa8.33□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W AMS1P22855 1083 aa8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data8.32□□□□□ -1.08not detected
YHC3YJL059W SEC6P32844 805 aa8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W MPE1P35728 441 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W BUD6P41697 788 aa8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W YJR142WP47173 342 aa8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W TY3B-GQ99315 1547 aa8.32□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W STU1P38198 1513 aa8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W PWP2P25635 923 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W ATG3P40344 310 aa8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W DNM1P54861 757 aa8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W NUT2Q06213 157 aa8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W YRR1Q12172 810 aa8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W NKP1Q12493 238 aa8.31□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W FUR4P05316 633 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W IES1P43579 692 aa8.3□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W TBF1Q02457 562 aa8.3□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W COG4Q06096 861 aa8.3□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W STH1P32597 1359 aa8.3□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W PHO87P25360 923 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W MET4P32389 672 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W UBP12P39538 1254 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W YEN1P40028 759 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W FYV10P40492 516 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W EMP47P43555 445 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W ACF4P47129 309 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W PNP1Q05788 311 aa8.29□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W USO1P25386 1790 aa8.28□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W HAP4P14064 554 aa8.28□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W ISF1P32488 338 aa8.28□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W VPS24P36095 224 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W GLO3P38682 493 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W MLP2P40457 1679 aa8.27□□□□□ -1.08
YHC3YJL059W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YHC3YJL059W ISW1P38144 1129 aa8.27□□□□□ -1.09
YHC3YJL059W RRD1P40454 393 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YHC3YJL059W QDR1P40475 563 aa8.27□□□□□ -1.09
YHC3YJL059W ESF2P53743 316 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YHC3YJL059W RMD1Q03441 430 aa8.27□□□□□ -1.09
YHC3YJL059W BDF2Q07442 638 aa8.27□□□□□ -1.09
YHC3YJL059W BOL3P39724 118 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.7 ms