RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	OSH7	P38755	437 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	SSN2	P38931	1420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	KAP122	P32767	1081 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	PPX1	P38698	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	YTA6	P40328	754 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	SPR3	P41901	512 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	TRS120	Q04183	1289 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	WHI5	Q12416	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	RPC31	P17890	251 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	SEC20	P28791	383 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	RGA1	P39083	1007 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	MNL2	Q12205	849 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
RIM4	YHL024W	LDH1	P38139	375 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	MTO1	P53070	669 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	SCW11	P53189	542 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	YDR444W	Q04093	687 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	GPI13	Q07830	1017 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	HEM3	P28789	327 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	DYS1	P38791	387 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	HXT8	P40886	569 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIM4	YHL024W	IOC4	Q04213	475 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	MSN1	P22148	382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	UFD2	P54860	961 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	RGP1	P16664	663 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	BSD2	P38356	321 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	SKP1	P52286	194 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	MET4	P32389	672 aa		5	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	RGD2	P43556	714 aa		5	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	YOR296W	Q08748	1289 aa		5	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	CCP1	P00431	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	SMC1	P32908	1225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	ROG3	P43602	733 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	MRPL16	P38064	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	GIP1	P38229	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	ACO2	P39533	789 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	NTA1	P40354	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	ATE1	P16639	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	ISW1	P38144	1129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	STB3	Q12427	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	RAD55	P38953	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	THI12	P42883	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	THI5	P43534	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	THI11	P47183	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	ITC1	P53125	1264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	YNR040W	P53736	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	YNL011C	P53980	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	RSC4	Q02206	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	THI13	Q07748	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	YIR007W	P40566	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RIM4	YHL024W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	FIR1	P40020	876 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	CUZ1	P53899	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	CDC55	Q00362	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	DIT1	P21623	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	APM2	P38700	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	PSY2	P40164	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	POL32	P47110	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	CAF120	P53836	1060 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	MSC7	P38694	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	YIL165C	P40446	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	ASF1	P32447	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	AIM46	P38885	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	DAK2	P43550	591 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	CTR9	P89105	1077 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	BSC2	Q05611	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	COB	P00163	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	IDI1	P15496	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	YBR287W	P38355	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	YJR107W	P47145	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	TOS4	Q06266	489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIM4	YHL024W	FPS1	P23900	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.5 ms