RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN4	YEL009C	BRL1	P38770	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GCN4	YEL009C	MTO1	P53070	669 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GCN4	YEL009C	YNL165W	P53891	406 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GCN4	YEL009C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GCN4	YEL009C	APM2	P38700	605 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	YGR130C	P53278	816 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	NTH2	P35172	780 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	CTH1	P47976	325 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	CYC7	P00045	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	SPO74	P45819	413 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	DSE4	P53753	1117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	KAP122	P32767	1081 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	SCD5	P34758	872 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN4	YEL009C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	TSC13	Q99190	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	CYT1	P07143	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	NIT1	P40447	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	YKL222C	P35995	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
GCN4	YEL009C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	AKR1	P39010	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	ECL1	P48235	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	RIM21	P48565	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	RNQ1	P25367	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	YCR015C	P25616	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	GIP2	P40036	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	YNL108C	P53929	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	GIS1	Q03833	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	RSC2	Q06488	889 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN4	YEL009C	RPC31	P17890	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	IDI1	P15496	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	BIO2	P32451	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	YNR040W	P53736	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	REC8	Q12188	680 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	TED1	P40533	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	LEM3	P42838	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	LEU3	P08638	886 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	UBP1	P25037	809 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	SEG2	P34250	1132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	NSI1	Q12457	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	MRP10	O75012	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN4	YEL009C	ESC8	Q08119	714 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	HAP4	P14064	554 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	HXT5	P38695	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	QDR2	P40474	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	ITC1	P53125	1264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	GAS4	Q08271	471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	GUP1	P53154	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	DFG16	Q99234	619 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	PKC1	P24583	1151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	YBR287W	P38355	427 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	DYS1	P38791	387 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	CWH41	P53008	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	PHO87	P25360	923 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	LRG1	P35688	1017 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	GIP1	P38229	639 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GCN4	YEL009C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	SDH1	Q00711	640 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	MRX10	Q05648	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	GIC2	Q06648	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	PAN5	P38787	379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	GIP4	P39732	760 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	NCE103	P53615	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	ISW1	P38144	1129 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	YJL181W	P46987	611 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	YJL007C	P47080	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	PPT1	P53043	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	VAN1	P23642	535 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	PEP12	P32854	288 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	LDH1	P38139	375 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	MMM1	P41800	426 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	HDA2	Q06629	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCN4	YEL009C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	SIS2	P36024	562 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	YHL008C	P38750	627 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66

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