RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RGP1	P16664	663 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	PRD1	P25375	712 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	XRS2	P33301	854 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	SAP185	P40856	1058 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	BDF1	P35817	686 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RGD1	P38339	666 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	VHS3	Q08438	674 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	HAT1	Q12341	374 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	VPS45	P38932	577 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	CSE1	P33307	960 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	DJP1	P40564	432 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	COS5	P47187	383 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	VPS72	Q03388	795 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	PSK2	Q08217	1101 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	GSY1	P23337	708 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	PES4	P39684	611 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	ATG1	P53104	897 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	SDH5	Q08230	162 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	COB	P00163	385 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	SPR3	P41901	512 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	AAD16	Q02895	342 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	HIM1	Q06674	414 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	DPH6	Q12429	685 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	YJL049W	P47048	450 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	PSR2	Q07949	397 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	SIR4	P11978	1358 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RPC37	P36121	282 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RSC30	P38781	883 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	SEG2	P34250	1132 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	GLE1	Q12315	538 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RCR1	P38212	213 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	CIT1	P00890	479 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.47	□□□□□ -1.53	not detected
DNF2	YDR093W	CDC11	P32458	415 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	CDC15	P27636	974 aa		5.46	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	IRC8	P47046	822 aa		5.46	□□□□□ -1.53
DNF2	YDR093W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	CLN2	P20438	545 aa		5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	PPH3	P32345	308 aa		5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	DAL1	P32375	460 aa		5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YKU70	P32807	602 aa		5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	PEX5	P35056	612 aa		5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RTS1	P38903	757 aa		5.46	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	HIF1	Q12373	385 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SRS2	P12954	1174 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
DNF2	YDR093W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RBA50	Q04418	439 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	ALT2	P52892	507 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	JIP4	Q03361	876 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YMR074C	Q04773	145 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	VMR1	P38735	1592 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	LYS14	P40971	790 aa		5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	CTT1	P06115	562 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	SPC110	P32380	944 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YKL222C	P35995	705 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	JNM1	P36224	373 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	VAB2	P40003	282 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YLL058W	Q12198	575 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	RNT1	Q02555	471 aa		5.44	□□□□□ -1.54
DNF2	YDR093W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 86.2 ms