RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C ALD4P46367 519 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C AHP1P38013 176 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C MMS1Q06211 1407 aa3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C EDE1P34216 1381 aa3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SLD2P34252 453 aa3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YML020WQ03722 664 aa3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C MCM1P11746 286 aa3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YTA6P40328 754 aa3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C SRC1Q03707 834 aa3.79□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YJR098CP47139 656 aa3.78□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C NNF2P53253 936 aa3.78□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
DOA4YDR069C UBP2Q01476 1272 aa3.78□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C TCB1Q12466 1186 aa3.78□□□□□ -1.8
DOA4YDR069C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.77□□□□□ -1.81not detected
DOA4YDR069C MSN5P52918 1224 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C YPQ2Q06328 317 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C RLP24Q07915 199 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C YBL113CQ7M4S9 792 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C BUD4P47136 1447 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SUV3P32580 737 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C ISC10P32645 267 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C LTV1P34078 463 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C RGA1P39083 1007 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C Q0182Q9ZZW1 134 aa3.77□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C CDC11P32458 415 aa3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SCD5P34758 872 aa3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C YBR197CP38306 217 aa3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SSN3P39073 555 aa3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SUB1P54000 292 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C NHA1Q99271 985 aa3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C TRM732Q03496 1420 aa3.76□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SWI3P32591 825 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C GLO3P38682 493 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C JJJ2P46997 583 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C OPT2Q06593 877 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C APL5Q08951 932 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C ROX1P25042 368 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C IRE1P32361 1115 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C DAL1P32375 460 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SAP190P36123 1033 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SIC1P38634 284 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C ERP5P38819 212 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C MPP10P47083 593 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SCW11P53189 542 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C VPS72Q03388 795 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SMC4Q12267 1418 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C YVC1Q12324 675 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C MLP2P40457 1679 aa3.75□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C TOA1P32773 286 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C BOL3P39724 118 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C VTC4P47075 721 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C CAB1Q04430 367 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C GLY1P37303 387 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C HXT5P38695 592 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C STM1P39015 273 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C PEA2P40091 420 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C ATG1P53104 897 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C YDR444WQ04093 687 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C LSO1Q3E827 93 aa3.74□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C PDR10P51533 1564 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C MRPL33P20084 86 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C MLF3P32047 452 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C MET22P32179 357 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C QDR1P40475 563 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C CTR9P89105 1077 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C GIN4Q12263 1142 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data3.73□□□□□ -1.81not detected
DOA4YDR069C MTO1P53070 669 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C YNL165WP53891 406 aa3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C LDH1P38139 375 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SUT1P53032 299 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C RPC31P17890 251 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C GAR1P28007 205 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SLA1P32790 1244 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C RKM3P38222 552 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C OSH7P38755 437 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C SPR3P41901 512 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C ACF4P47129 309 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C UBP15P50101 1230 aa3.72□□□□□ -1.81
DOA4YDR069C VMA3P25515 160 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C KAP122P32767 1081 aa3.71□□□□□ -1.82
DOA4YDR069C VID30P53076 958 aa3.71□□□□□ -1.82
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