RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 CPS1P31327 1500 aa25.82■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 PTPRUQ92729 1446 aa25.81■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 SIRT1Q96EB6 747 aa25.81■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 CABP2Q9NPB3 220 aa25.81■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.8■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.79■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 TMC1Q8TDI8 760 aa25.78■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.77■■□□□ 1.72
INO80E-211ENST00000567987 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.76■■□□□ 1.71
INO80E-211ENST00000567987 CDK19Q9BWU1 502 aa25.75■■□□□ 1.71
INO80E-211ENST00000567987 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.75■■□□□ 1.71
INO80E-211ENST00000567987 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
INO80E-211ENST00000567987 CCDC184Q52MB2 194 aa25.72■■□□□ 1.71
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INO80E-211ENST00000567987 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.72■■□□□ 1.71
INO80E-211ENST00000567987 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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INO80E-211ENST00000567987 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.71■■□□□ 1.71
INO80E-211ENST00000567987 PIK3R4Q99570 1358 aa25.7■■□□□ 1.71
INO80E-211ENST00000567987 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.7■■□□□ 1.7
INO80E-211ENST00000567987 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
INO80E-211ENST00000567987 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
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INO80E-211ENST00000567987 PTCH1Q13635 1447 aa25.68■■□□□ 1.7
INO80E-211ENST00000567987 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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INO80E-211ENST00000567987 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.65■■□□□ 1.7
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INO80E-211ENST00000567987 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.64■■□□□ 1.69
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INO80E-211ENST00000567987 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.62■■□□□ 1.69
INO80E-211ENST00000567987 ADGRB2O60241 1585 aa25.61■■□□□ 1.69
INO80E-211ENST00000567987 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.61■■□□□ 1.69
INO80E-211ENST00000567987 CABP1Q9NZU7 370 aa25.61■■□□□ 1.69
INO80E-211ENST00000567987 A0A1W2PP64 1363 aa25.59■■□□□ 1.69
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INO80E-211ENST00000567987 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.57■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.57■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.57■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 NLRP13Q86W25 1043 aa25.55■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.54■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.54■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.53■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 ATP7BP35670 1465 aa25.53■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 USP32Q8NFA0 1604 aa25.53■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.53■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.52■■□□□ 1.68
INO80E-211ENST00000567987 NUTM2FA1L443 756 aa25.51■■□□□ 1.67
INO80E-211ENST00000567987 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
INO80E-211ENST00000567987 PPP2R1AP30153 589 aa25.49■■□□□ 1.67
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INO80E-211ENST00000567987 NWD1Q149M9 1564 aa25.47■■□□□ 1.67
INO80E-211ENST00000567987 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
INO80E-211ENST00000567987 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
INO80E-211ENST00000567987 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.45■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.45■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 MORC1Q86VD1 984 aa25.45■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.45■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 STRCQ7RTU9 1775 aa25.44■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 NSD2O96028 1365 aa25.43■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.42■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 FYB1O15117 783 aa25.41■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 ITSN1Q15811 1721 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 AKAP12Q02952 1782 aa25.4■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
INO80E-211ENST00000567987 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 ACEP12821 1306 aa25.39■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.651e-7■■□□□ 13.2
INO80E-211ENST00000567987 C14orf37Q86TY3 774 aa25.38■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.38■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.37■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.37■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.36■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.35■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.34■■□□□ 1.65
INO80E-211ENST00000567987 NME9Q86XW9 330 aa25.3■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 USP6P35125 1406 aa25.29■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 TMEM94Q12767 1356 aa25.29■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.28■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.27■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 MTHFSP49914 203 aa25.27■■□□□ 1.64
INO80E-211ENST00000567987 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.27■■□□□ 1.64
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