RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.71□□□□□ -0.7
CS-212ENST00000548567 ADGRL2O95490 1459 aa10.71□□□□□ -0.7
CS-212ENST00000548567 NLRP6P59044 892 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-212ENST00000548567 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CS-212ENST00000548567 CEP350Q5VT06 3117 aa10.7□□□□□ -0.7
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CS-212ENST00000548567 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.68□□□□□ -0.7
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CS-212ENST00000548567 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-212ENST00000548567 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-212ENST00000548567 JCADQ9P266 1359 aa10.67□□□□□ -0.7
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CS-212ENST00000548567 KLHL34Q8N239 644 aa10.66□□□□□ -0.7
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CS-212ENST00000548567 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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CS-212ENST00000548567 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.65□□□□□ -0.7
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CS-212ENST00000548567 ADGRB3O60242 1522 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 CLTCL1P53675 1640 aa10.64□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 SLC24A1O60721 1099 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.63□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 MROH2AA6NES4 1674 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 CPS1P31327 1500 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.713e-10■■■□□ 17.8
CS-212ENST00000548567 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.61□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.6□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.59□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.59□□□□□ -0.71
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CS-212ENST00000548567 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-212ENST00000548567 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 TET3O43151 1660 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 ALKQ9UM73 1620 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 PDE3BQ13370 1112 aa10.57□□□□□ -0.72
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CS-212ENST00000548567 PNPLA6Q8IY17 1366 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 KIAA0232Q92628 1395 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 SMIM5Q71RC9 77 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 GCP02774 474 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
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CS-212ENST00000548567 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 MSH5O43196 834 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 APBA3O96018 575 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.53□□□□□ -0.72
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