RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 FKBP8Q14318 412 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP2R1AP30153 589 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 MED14O60244 1454 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ALKQ9UM73 1620 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.51□□□□□ -0.09
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SH3BP2-209ENST00000504450 NEFLP07196 543 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 EVC2Q86UK5 1308 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 LTKP29376 864 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 NUDCQ9Y266 331 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 EID1Q9Y6B2 187 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 DLC1Q96QB1 1528 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 STK26Q9P289 416 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC11Q96J66 1382 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 USP32Q8NFA0 1604 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 BCANQ96GW7 911 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAM1Q96QH2 718 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 PDE3BQ13370 1112 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SIRT1Q96EB6 747 aa14.43□□□□□ -0.1
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SH3BP2-209ENST00000504450 CABP2Q9NPB3 220 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 POGKQ9P215 609 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SLIT1O75093 1534 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-209ENST00000504450 NSD2O96028 1365 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 METP08581 1390 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK19Q9BWU1 502 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 TECPR2O15040 1411 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM94Q12767 1356 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 MORC1Q86VD1 984 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PP64 1363 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF521Q96K83 1311 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNA6P17658 529 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.34□□□□□ -0.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
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SH3BP2-209ENST00000504450 FYB1O15117 783 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 NGEFQ8N5V2 710 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 CABP1Q9NZU7 370 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 MTHFSP49914 203 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP7BP35670 1465 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 C14orf37Q86TY3 774 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 MSH6P52701 1360 aa14.29□□□□□ -0.12
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SH3BP2-209ENST00000504450 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
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