RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 NLRP1Q9C000 1473 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 CABP2Q9NPB3 220 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 PRAM1Q96QH2 718 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 RALBP1Q15311 655 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 PLPPR3Q6T4P5 718 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 ITSN1Q15811 1721 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 PPP2R1AP30153 589 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 ADGRB2O60241 1585 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 TECPR2O15040 1411 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1W2PP64 1363 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-212ENST00000497037 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.59□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.59□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.59□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 NLRP13Q86W25 1043 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ABCC11Q96J66 1382 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ATP7BP35670 1465 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 TMC1Q8TDI8 760 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 EVC2Q86UK5 1308 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 CDCA8Q53HL2 280 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 CDK19Q9BWU1 502 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 DIP2AQ14689 1571 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 PEAK1Q9H792 1746 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 FBLN1P23142 703 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 POGKQ9P215 609 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 CABP1Q9NZU7 370 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 FKBP8Q14318 412 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 BCANQ96GW7 911 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 PIK3C2AO00443 1686 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-212ENST00000497037 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 FYB1O15117 783 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 PTCH1Q13635 1447 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 INSRP06213 1382 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF521Q96K83 1311 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 NWD1Q149M9 1564 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 USP54Q70EL1 1684 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDCQ9Y266 331 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 STRCQ7RTU9 1775 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC24A1O60721 1099 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 SIRT1Q96EB6 747 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 NUTM2FA1L443 756 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 MTHFSP49914 203 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 MORC1Q86VD1 984 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms