RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482320.5

TNPO3-204, Transcript of transportin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNPO3, Length 3,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO3-204	ENST00000482320	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	MYOM2	P54296	1465 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	ERVK-7	P63135	1459 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	ADGRB2	O60241	1585 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	LTK	P29376	864 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	TMF1	P82094	1093 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	USP35	Q9P2H5	1018 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	ARID3A	Q99856	593 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	ADGRB3	O60242	1522 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TNPO3-204	ENST00000482320	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	CLTCL1	P53675	1640 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	PRAM1	Q96QH2	718 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	PLIN1	O60240	522 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	CDCA8	Q53HL2	280 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	GSE1	Q14687	1217 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	AKAP12	Q02952	1782 aa		10.72	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	CABP2	Q9NPB3	220 aa		10.71	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.71	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.71	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	PTPRM	P28827	1452 aa		10.71	□□□□□ -0.69
TNPO3-204	ENST00000482320	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		10.71	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		10.71	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	KIF1B	O60333	1816 aa		10.7	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	RGS3	P49796	1198 aa		10.7	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		10.7	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		10.7	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	PDE4A	P27815	886 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	NLRP1	Q9C000	1473 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	EVC2	Q86UK5	1308 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	ITSN1	Q15811	1721 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	NUDC	Q9Y266	331 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	PANK3	Q9H999	370 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	KCNA6	P17658	529 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	CCDC7	Q96M83	1385 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	TBX22	Q9Y458	520 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	CDK19	Q9BWU1	502 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	MET	P08581	1390 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TNPO3-204	ENST00000482320	TESK2	Q96S53	571 aa		10.65	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	LRRC37A3	O60309	1634 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	PIK3C2G	O75747	1445 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	ZMYND15	Q9H091	742 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	SOX12	O15370	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.9 ms