RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475527.1

PTPRG-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRG, Length 2,694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-205ENST00000475527 MORC1Q86VD1 984 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRG-205ENST00000475527 TRPM2O94759 1503 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRG-205ENST00000475527 CLCN1P35523 988 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 CLTCL1P53675 1640 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 WDR63Q8IWG1 891 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 SLC24A1O60721 1099 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 MRE11P49959 708 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 HSCBQ8IWL3 235 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 PTPRTO14522 1441 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRG-205ENST00000475527 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 SHPRHQ149N8 1683 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 MTHFSP49914 203 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 AFAP1Q8N556 730 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRG-205ENST00000475527 CCDC27Q2M243 656 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 CFAP53Q96M91 514 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 PLCH2O75038 1416 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 ABCA6Q8N139 1617 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 ESPNB1AK53 854 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 TRIM27P14373 513 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 KANK1Q14678 1352 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 ERBB4Q15303 1308 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 ABCC1P33527 1531 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRG-205ENST00000475527 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.31■■□□□ 1.64
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PTPRG-205ENST00000475527 SHROOM2Q13796 1616 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 TET3O43151 1660 aa25.3■■□□□ 1.64
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PTPRG-205ENST00000475527 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 DDIT3P35638 169 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 MYOM2P54296 1465 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 SMC5Q8IY18 1101 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 GBP4Q96PP9 640 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRG-205ENST00000475527 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 SNX21Q969T3 373 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 LNPKQ9C0E8 428 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 DEPDC5O75140 1603 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 NUCB1Q02818 461 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.2■■□□□ 1.63
PTPRG-205ENST00000475527 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 NOS1P29475 1434 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 KIF1BO60333 1816 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 ZMYND15Q9H091 742 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRG-205ENST00000475527 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.17■■□□□ 1.62
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