RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.34■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.33■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC7Q96M83 1385 aa22.31■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.31■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.3■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.29■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 TESK2Q96S53 571 aa22.27■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 MED14O60244 1454 aa22.27■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.27■■□□□ 1.16
CNGA3-205ENST00000436404 EID1Q9Y6B2 187 aa22.26■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 GSE1Q14687 1217 aa22.25■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 METP08581 1390 aa22.25■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.23■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.23■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 PDE4AP27815 886 aa22.23■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.22■■□□□ 1.15
CNGA3-205ENST00000436404 BACH2Q9BYV9 841 aa22.2■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.2■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 DIP2AQ14689 1571 aa22.2■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.19■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 MS4A1P11836 297 aa22.19■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.18■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 STK26Q9P289 416 aa22.18■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.17■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 DLC1Q96QB1 1528 aa22.17■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.17■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.16■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC11Q96J66 1382 aa22.15■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRUQ92729 1446 aa22.15■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.15■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 TECPR2O15040 1411 aa22.14■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.14■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 TBX22Q9Y458 520 aa22.14■■□□□ 1.14
CNGA3-205ENST00000436404 CPS1P31327 1500 aa22.14■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.11■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 TMF1P82094 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 NFKBIBQ15653 356 aa22.1■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.1■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 HSPA2P54652 639 aa22.09■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 PRAM1Q96QH2 718 aa22.09■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.09■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CNGA3-205ENST00000436404 MYOM1P52179 1685 aa22.07■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 STRCQ7RTU9 1775 aa22.07■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.07■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.06■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.06■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.06■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.06■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.06■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 PIK3R4Q99570 1358 aa22.05■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 SIRT1Q96EB6 747 aa22.05■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 POGKQ9P215 609 aa22.03■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.03■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 SLC24A1O60721 1099 aa22.02■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 PTCH1Q13635 1447 aa22.02■■□□□ 1.12
CNGA3-205ENST00000436404 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 CDCA8Q53HL2 280 aa21.98■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.98■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 NWD1Q149M9 1564 aa21.98■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 KCNA6P17658 529 aa21.97■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 EVC2Q86UK5 1308 aa21.97■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRB2O60241 1585 aa21.97■■□□□ 1.11
CNGA3-205ENST00000436404 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.95■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.95■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 TMC1Q8TDI8 760 aa21.93■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 CABP2Q9NPB3 220 aa21.92■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.91■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 CDK19Q9BWU1 502 aa21.91■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.9■■□□□ 1.1
CNGA3-205ENST00000436404 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 PANK3Q9H999 370 aa21.89■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.88■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 SLC4A3P48751 1232 aa21.87■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.85■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.85■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 USP32Q8NFA0 1604 aa21.84■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 PDE3BQ13370 1112 aa21.83■■□□□ 1.09
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