RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abca14E9Q8F8 1683 aa28.22■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp40Q8BWR4 1235 aa28.21■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IqubQ8CDK3 788 aa28.21■■■□□ 2.11
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa28.2■■■□□ 2.1
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nphp4P59240 1425 aa28.15■■■□□ 2.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa28.15■■■□□ 2.1
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wnk3Q80XP9 1757 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DccP70211 1447 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Qtrt2B8ZXI1 415 aa28.08■■■□□ 2.09
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa28.07■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcna6Q61923 529 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GnpatP98192 678 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nyap1Q6PFX7 833 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa28.04■■■□□ 2.08
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Farp2Q91VS8 1065 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stard8Q8K031 1019 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp142G5E869 1843 aa28.01■■■□□ 2.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem2Q5FWI3 1383 aa28.01■■■□□ 2.08
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abcc10Q8R4P9 1501 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Srcin1Q9QWI6 1250 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Camta1A2A891 1682 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NktrP30415 1453 aa27.99■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zbtb4Q5F293 982 aa27.99■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rundc1Q0VDN7 615 aa27.98■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GapdhsQ64467 440 aa27.95■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf526Q8BI66 675 aa27.95■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kif1aP33173 1695 aa27.95■■■□□ 2.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdk19Q8BWD8 501 aa27.94■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CenpjQ569L8 1344 aa27.93■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Card11Q8CIS0 1159 aa27.93■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sirt1Q923E4 737 aa27.91■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa27.91■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NgefQ8CHT1 710 aa27.9■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa27.9■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cypt2Q6P924 180 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf316Q6PGE4 1016 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TonslQ6NZL6 1363 aa27.89■■■□□ 2.06
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ap3b2Q9JME5 1082 aa27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cntnap1O54991 1385 aa27.87■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slit2Q9R1B9 1521 aa27.86■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zranb1Q7M760 708 aa27.86■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mon2Q80TL7 1715 aa27.84■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NefmP08553 848 aa27.83■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adgrl1Q80TR1 1466 aa27.83■■■□□ 2.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbln2P37889 1221 aa27.83■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr17E9Q271 1322 aa27.82■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa27.82■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gsto1O09131 240 aa27.81■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp7bQ64446 1462 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtprvP70289 1705 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ggt6Q6PDE7 497 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Siglec1Q62230 1695 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrp6O88572 1613 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtpruB1AUH1 1446 aa27.77■■■□□ 2.04
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smim5Q8BT42 78 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam135bQ9DAI6 1403 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 InsrP15208 1372 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MypopQ8R4U1 393 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc35g1Q8BY79 368 aa27.74■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp10bB1AWN4 1474 aa27.74■■■□□ 2.03
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Idi2Q8BFZ6 227 aa27.7■■■□□ 2.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Map3k19E9Q3S4 1311 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abca15E9PWH4 1668 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fyb1O35601 819 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cadps2Q8BYR5 1297 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acsbg1Q99PU5 721 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CatipB9EKE5 520 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tex14Q7M6U3 1450 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dixdc1Q80Y83 711 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sbno1Q689Z5 1390 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cnga1P29974 684 aa27.62■■■□□ 2.01
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