RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeastyeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1YPL253C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C AIM19P40502 157 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C ICS3P47034 131 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SNN1P48232 102 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SAE3P89114 91 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SGF11Q03067 99 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SPC2Q04969 178 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YLR361C-AQ3E795 98 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C MED11Q99278 115 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C POL1P13382 1468 aa-0.06□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C PDR11P40550 1411 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C TRM732Q03496 1420 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C HMRA1P0CY11 126 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YBR016WP38216 128 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YER187WP40102 141 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C GTT1P40582 234 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YGR042WP53227 271 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C MRX7P53869 86 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C DYN2Q02647 92 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YPL261CQ08976 102 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YOR192C-CQ3E736 78 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YCR095W-AQ3E787 52 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YLR365WQ7LIF2 110 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C LYS2P07702 1392 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C DNF2Q12675 1612 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPB11P38902 120 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C GIM4P40005 111 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C EMC5P40540 141 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C IMP2P46972 177 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C AIM11P87275 137 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C APS2Q00381 147 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YDR042CQ03205 200 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C FYV7Q12247 151 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YLR118CQ12354 227 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YGL041C-BQ3E750 60 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YOS1Q3E834 85 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YMR122W-AQ3E842 84 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C OST5Q92316 86 aa-0.07□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C USO1P25386 1790 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C ECM12O13529 151 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C FPR2P32472 135 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YBL044WP38194 122 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YNL198CP40166 100 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C CWP2P43497 92 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPL38P49167 78 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C MPC1P53157 130 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SNA2P56508 79 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C ICY1Q04329 127 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C CNL1Q06333 122 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YDR029WQ12111 104 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C DAD1Q12248 94 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YCR075W-AQ3E830 75 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C KSH1Q8TGJ3 72 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C Q0144Q9ZZW2 109 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C DNF1P32660 1571 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C PDR10P51533 1564 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C GCN2P15442 1659 aa-0.08□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RSF2P46974 1380 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YAL065CO13511 128 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YOR304C-AO14468 76 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YCR099CP25657 155 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C LSM2P38203 95 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YIL086CP40503 102 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YGL204CP53089 101 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C ATP18P81450 59 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C NKP2Q06162 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C FRQ1Q06389 190 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YOL118CQ08259 102 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YLR363W-AQ3E747 85 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YOR093CQ12275 1648 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SWR1Q05471 1514 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C GDB1Q06625 1536 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SSN2P38931 1420 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YSP2Q06681 1438 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YBT1P32386 1661 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C DOP1Q03921 1698 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C RPO31P04051 1460 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YHR214C-DP0CX93 97 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C UBC4P15731 148 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YHL005CP38752 130 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C HUR1P45820 110 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C ZEO1Q08245 113 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C YDR246W-AQ3E763 66 aa-0.09□□□□□ -2.42
VIK1YPL253C SLO1Q3E784 85 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 96.5 ms