RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A SRB6P32570 121 aa0.55□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A RPL37BP51402 88 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A LSM6Q06406 86 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A YOL118CQ08259 102 aa0.55□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A MIC10Q96VH5 97 aa0.55□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A RPA190P10964 1664 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A CCW14O13547 238 aa0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A RPL43BP0CX26 92 aa0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A PAU16P35994 123 aa0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A YHL005CP38752 130 aa0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A PAU15P40585 124 aa0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A IMP2P46972 177 aa0.54□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A PDR10P51533 1564 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A YER188C-AP0C0V2 99 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A YJR128WP47162 119 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A MRPS12P53732 153 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A COX12Q01519 83 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A COX19Q3E731 98 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A YOR034C-AQ3E735 80 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A KSH1Q8TGJ3 72 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A RSF2P46974 1380 aa0.53□□□□□ -2.32
YHL009W-AYHL009W-A MRP17P28778 131 aa0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YIL086CP40503 102 aa0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A EMC5P40540 141 aa0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A RSM19P53733 91 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A LCL1Q02786 101 aa0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YDR210WQ03482 75 aa0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SRB8P25648 1427 aa0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SWR1Q05471 1514 aa0.52□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SKI3P17883 1432 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A ROX3P25046 220 aa0.51□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A MSL1P40567 111 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SNA2P56508 79 aa0.51□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YBR072C-AQ3E794 53 aa0.51□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YPL038W-AQ3E7B4 63 aa0.51□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SSN2P38931 1420 aa0.5□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SHU1P38751 150 aa0.5□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A MRX7P53869 86 aa0.5□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YCR095W-AQ3E787 52 aa0.5□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SEC16P48415 2195 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YBR292CP38357 123 aa0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A GCV3P39726 170 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A AIM19P40502 157 aa0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A PAU5P43575 122 aa0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YDR029WQ12111 104 aa0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YDR010CQ12426 110 aa0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YLR307C-AQ3E825 87 aa0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A TY4B-HP0C2J7 1802 aa0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A GDB1Q06625 1536 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YLR255CO13574 117 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YLR157W-EP0CF00 54 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A HMRA1P0CY11 126 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A MPC2P38857 129 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A RSM18P40033 138 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SUS1Q6WNK7 96 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YCL001W-BQ96VH2 84 aa0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SEC7P11075 2009 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A LTE1P07866 1435 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YRF1-1P0CX20 1796 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YRF1-5P0CX21 1796 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YRF1-8P0CX22 1796 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YBL071CP38185 102 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YHR173CP38864 112 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A SNU13P39990 126 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YDR042CQ03205 200 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A ICY1Q04329 127 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A PAU20Q08322 120 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A RRT15Q3E811 62 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A MHF2Q3E829 80 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A YCR075W-AQ3E830 75 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A LAA1P39526 2014 aa0.47□□□□□ -2.33
YHL009W-AYHL009W-A DNF3Q12674 1656 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A ESP1Q03018 1630 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A ECM12O13529 151 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU1P0CE88 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU14P0CE89 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU6P0CE90 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU18P0CE91 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU8P0CE92 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU11P0CE93 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PDX3P38075 228 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU13P38725 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU10Q03050 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A NHP10Q03435 203 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A YMR082CQ04276 118 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A PAU9Q3E770 120 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A YNR034W-AQ3E841 98 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A RIM15P43565 1770 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A BNI1P41832 1953 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A POL1P13382 1468 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A MYO1P08964 1928 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A YRF1-2P40105 1681 aa0.46□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A AUA1P32450 94 aa0.45□□□□□ -2.34
YHL009W-AYHL009W-A SPC1P46965 94 aa0.45□□□□□ -2.34
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