RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YOR343CQ12484 108 aa2.08□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YMR316C-AI2HB70 103 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MDM35O60200 86 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W UBC5P15732 148 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W PHO85P17157 305 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YPS1P32329 569 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MRPS5P33759 307 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W SFT2P38166 215 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W ERG28P40030 148 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W GON7P46984 123 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W LCB3P47013 409 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W EAF6P47128 113 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W KNH1P50112 268 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W SBH1P52870 82 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W NCE101Q02820 53 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W COF1Q03048 143 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YDR042CQ03205 200 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W IRC19Q07843 230 aa2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W CSH1P38287 376 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YIL029CP40538 142 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W AIM11P87275 137 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YMR103CQ04436 120 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W UPS1Q05776 175 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W RRG8Q06109 277 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YPS3Q12303 508 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa2.06□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W FZF1P32805 299 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YHL042WP38729 150 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W TVP23P38962 199 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W LST8P41318 303 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YFR057WP43625 151 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W UBC13P52490 153 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W COX12Q01519 83 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MSA1Q08471 629 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W VPS68Q12016 184 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W FCY1Q12178 158 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W DAD1Q12248 94 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W TOM40P23644 387 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W IMP1P28627 190 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W TOM6P33448 61 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W NRG2P38082 220 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W GPI18P38211 433 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YHR140WP38842 239 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YNL217WP40152 326 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YFR054CP43622 192 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W FIP1P45976 327 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W TOM7P53507 60 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YDR102CQ03864 110 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YOL118CQ08259 102 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W FIT2Q08906 153 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YOR192C-CQ3E736 78 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YGL258W-AQ3E740 77 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W KTI11Q3E840 82 aa2.05□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YHR139C-AO13536 103 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W IES6P32617 166 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W VEL1P53058 206 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MST27P53176 234 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YGR018CP53211 109 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W MRPL19P53875 158 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YHP1Q04116 353 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YPL261CQ08976 102 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W BOL1Q3E793 110 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.04□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W VPS63O13549 108 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W ROX3P25046 220 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W INO2P26798 304 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YKL097CP34245 136 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W DSE2P38844 325 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W PET8P38921 284 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W HUA1P40325 198 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W VPS55P47111 140 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W PGU1P47180 361 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W ALG13P53178 202 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W HST4P53688 370 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W GPI19Q04082 140 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W IGO2Q9P305 131 aa2.03□□□□□ -2.08
YKR078WYKR078W YAL064W-BO13512 126 aa2.03□□□□□ -2.09
YKR078WYKR078W Q0255P03881 472 aa2.03□□□□□ -2.09
YKR078WYKR078W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.09
YKR078WYKR078W YMR31P19955 123 aa2.03□□□□□ -2.09
YKR078WYKR078W YCR050CP25630 102 aa2.03□□□□□ -2.09
YKR078WYKR078W FPR2P32472 135 aa2.03□□□□□ -2.09
YKR078WYKR078W YKL070WP36087 169 aa2.03□□□□□ -2.09
YKR078WYKR078W SMP1P38128 452 aa2.03□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 116.2 ms