RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C GPI19Q04082 140 aa2.57□□□□□ -2
DOA4YDR069C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
DOA4YDR069C YHR139C-AO13536 103 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C CSH1P38287 376 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C YAR029WP39549 74 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C UBC13P52490 153 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C ATP19P81451 68 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C YDR102CQ03864 110 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C YOL029CQ08187 201 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C SPO13P23624 291 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C YBR144CP34215 104 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C APS1P35181 156 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C RRT13P40042 185 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C YLR281CQ05863 155 aa2.56□□□□□ -2
DOA4YDR069C YNL217WP40152 326 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C CDC1P40986 491 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C YOR186WQ08560 144 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C YDL211CQ12121 372 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C EMC6Q12431 108 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C BET1P22804 142 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C IMP1P28627 190 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C HOT13P36078 116 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C VPS25P47142 202 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C ATP23P53722 227 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C SLG1P54867 378 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C CTR2P38865 189 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C YGR269WP40326 108 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C MET31Q03081 177 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C GAT3Q07928 141 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa2.55□□□□□ -2
DOA4YDR069C RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C PGU1P47180 361 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C YGL193CP53097 103 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C ROX3P25046 220 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C ERG2P32352 222 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C SWD3P38123 315 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C YHR180WP38868 163 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C SPI1P40092 148 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C SIM1P40472 476 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C YPI1P43587 155 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C PIR5P46999 287 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C MST27P53176 234 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C YIL014C-AQ02598 104 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C MCH4Q08268 501 aa2.54□□□□□ -2
DOA4YDR069C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C YSY6P38374 65 aa2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C YHL005CP38752 130 aa2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C SPG1P50088 95 aa2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C PIR1Q03178 341 aa2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C YDL009CQ12210 107 aa2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.53□□□□□ -2not detected
DOA4YDR069C VPS55P47111 140 aa2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C YNL234WP53857 426 aa2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
DOA4YDR069C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C PAU7P39545 55 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C ECO1P43605 281 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MIM1Q08176 113 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C TSC3Q3E790 80 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YLR365WQ7LIF2 110 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C PFY1P07274 126 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YHR213WP0CI67 198 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YML122CQ03207 126 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C IRC23Q08416 157 aa2.52□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YER187WP40102 141 aa2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YOR343CQ12484 108 aa2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C COA3Q3E7B2 85 aa2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C TDA8Q6B2U8 126 aa2.51□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YMR316C-AI2HB70 103 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YKR045CP36138 183 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MTC6P38849 526 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YGL034CP53186 121 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C PPT2Q12036 173 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MIC10Q96VH5 97 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YHR214C-DP0CX93 97 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C ARF1P11076 181 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C CSE2P33308 149 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YHR173CP38864 112 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YFR035CP43608 114 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C HUR1P45820 110 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YMR007WQ03675 126 aa2.5□□□□□ -2.01
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