RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa2.91□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.91□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C VPS63O13549 108 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C Q0255P03881 472 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YCR006CP25350 157 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C GPI18P38211 433 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C OM14P38325 134 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C PAU7P39545 55 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C GLE2P40066 365 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C UBC11P52492 156 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C BRR6P53062 197 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SDS23P53172 527 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C HST4P53688 370 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YNR071CP53757 342 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C CUZ1P53899 274 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C ERG13P54839 491 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SDC1Q03323 175 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C IRC25Q07951 179 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YOR186WQ08560 144 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RLM1Q12224 676 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YPS3Q12303 508 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YBR255C-AQ3E776 120 aa2.9□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPB8P20436 146 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SMP1P38128 452 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YHR140WP38842 239 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YHR173CP38864 112 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YNL217WP40152 326 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C KNH1P50112 268 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C PET191Q02772 108 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C COF1Q03048 143 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YMR103CQ04436 120 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RAF1Q06891 181 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MCH4Q08268 501 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C HRT1Q08273 121 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MSA1Q08471 629 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C TIM18Q08749 192 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YOR029WQ12243 111 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SUT2Q12286 268 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C HUG1Q6Q5K6 68 aa2.89□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YMR316C-AI2HB70 103 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YCR050CP25630 102 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C FZF1P32805 299 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SPC29P33419 253 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YFR057WP43625 151 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C PIR1Q03178 341 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C USV1Q12132 391 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa2.88□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C TRP1P00912 224 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YMR31P19955 123 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C IMP1P28627 190 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
SPT4YGR063C FIP1P45976 327 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C CIS3P47001 227 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MST27P53176 234 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YNL046WP53956 172 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YDR215CQ12240 137 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C DAD1Q12248 94 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YKL183C-AQ3E765 70 aa2.87□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YHR139C-AO13536 103 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C FPR2P32472 135 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SFT2P38166 215 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C LST8P41318 303 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C VPS55P47111 140 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MMS2P53152 137 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C NCE103P53615 221 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MGR2Q02889 113 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C GPI19Q04082 140 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YMR317WQ04893 1140 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YLR042CQ07990 161 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MIM1Q08176 113 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YMR175W-AQ3E766 64 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C KSH1Q8TGJ3 72 aa2.86□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YLR302CO13544 120 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C AQY1P0CD91 305 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C HSP12P22943 109 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C ROX3P25046 220 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPS2P25443 254 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MLF3P32047 452 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YHR180WP38868 163 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C SFT1P43682 97 aa2.85□□□□□ -1.95
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