RNA–Protein interactions for RNA: YOR271C

FSF1, Transcript of Putative protein, yeast

Gene FSF1, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FSF1	YOR271C	AUA1	P32450	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	HSP10	P38910	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	PAU5	P43575	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	CAB4	P53332	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	PDR17	P53844	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	ATG5	Q12380	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	MRPL44	P19956	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YUH1	P35127	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	GEP3	Q08622	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	COA6	Q3E846	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
FSF1	YOR271C	CMC1	P36064	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	IRC22	P40006	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	ATG27	P46989	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YHP1	Q04116	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YFH1	Q07540	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YOP1	Q12402	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	COX2	P00410	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	FUN14	P18411	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	QCR9	P22289	66 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	COQ3	P27680	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	AIM24	P47127	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	DAD3	P69850	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	APS2	Q00381	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	MCH1	Q07376	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	ERV2	Q12284	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	MDM10	P18409	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	PCL7	P40186	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YGR269W	P40326	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	HIT1	P46973	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YGR149W	P48236	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	TOS8	P53147	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	FCY2	P17064	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YMR31	P19955	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	ROX3	P25046	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	HOT13	P36078	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	QDR3	P38227	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	COX15	P40086	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	OST3	P48439	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YGR050C	P53231	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	LST7	P53237	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	HCH1	P53834	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	LPP1	Q04396	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	MHR1	Q06630	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FSF1	YOR271C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	YGL010W	P25338	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	ACP1	P32463	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	YBL059W	P34224	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	ATP23	P53722	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	SCW10	Q04951	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	HRD1	Q08109	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	ATX2	Q12067	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	DAD2	P36162	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	MSC3	Q05812	728 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	NAT3	Q06504	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	FYV7	Q12247	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	MPC2	P38857	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	GPI2	P46961	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	YDR274C	P87283	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	LOA1	Q06508	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	NDE2	Q07500	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	VPS63	O13549	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	HMX1	P32339	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	YKR045C	P36138	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	DER1	P38307	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	CRH1	P53301	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	ATC1	Q04005	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	LDS2	Q08218	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FSF1	YOR271C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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