RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C YOR338WQ99326 363 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN11YML043C ENV10Q99382 181 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FIG2P25653 1609 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN11YML043C MSB2P32334 1306 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C RPA12P32529 125 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C VID24P38263 362 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C INM1P38710 295 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YIL169CP40442 995 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YIR016WP40572 265 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YPL039WQ03080 316 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C NAT3Q06504 195 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SYM1Q06563 197 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YLR412C-AQ3E742 68 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C BOL1Q3E793 110 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FMP49A0A023PZB3 126 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C COX9P07255 59 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C MMS2P53152 137 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C CAX4P53223 239 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YGR219WP53307 113 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C BUD25P85052 153 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SDC1Q03323 175 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YMR103CQ04436 120 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YFH1Q07540 174 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FCY1Q12178 158 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YLL053CP0CD98 152 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MRS4P23500 304 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.84not detected
RRN11YML043C MRP21P38175 177 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.59□□□□□ -1.84not detected
RRN11YML043C CTK2P46962 323 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YLR152CP54072 576 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YAL063C-AQ3E791 96 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SNF11P38956 169 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YAR068WP39564 161 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YEL028WP39989 153 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SFT1P43682 97 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C BAT2P47176 376 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C KNH1P50112 268 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C VPS71Q03433 280 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C TRS23Q03784 219 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YDL242WQ07746 117 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C NDD1Q08887 554 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YFL041W-AQ3E817 63 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MDM10P18409 493 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C TOM40P23644 387 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C AGA2P32781 87 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YPT10P38146 199 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84 RIP-Chip
RRN11YML043C BRR6P53062 197 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C HSK3P69852 69 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MRX11Q03079 207 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SLM3Q12093 417 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C ODC2Q99297 307 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YCR050CP25630 102 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YPS1P32329 569 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C PAM17P36147 197 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C ANS1P38832 159 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C ELO1P39540 310 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MST28P39552 234 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C VPS25P47142 202 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YGR164WP53291 111 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MET31Q03081 177 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C HPA2Q06592 156 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RAF1Q06891 181 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C GEP3Q08622 556 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C COX5AP00424 153 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RPL28P02406 149 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MDH2P22133 377 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YCR025CP25352 136 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C AHT1P29589 182 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C IES6P32617 166 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SVP26P38869 228 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.55□□□□□ -1.84not detected
RRN11YML043C TIS11P47977 285 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YML122CQ03207 126 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C LPP1Q04396 274 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YOR105WQ08504 108 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C KSH1Q8TGJ3 72 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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