RNA–Protein interactions for RNA: YHR181W

SVP26, Transcript of Integral membrane protein of the early Golgi apparatus and ER, yeast

Gene SVP26, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVP26	YHR181W	SSN2	P38931	1420 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SVP26	YHR181W	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SVP26	YHR181W	YCR001W	P25347	104 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SVP26	YHR181W	TMA23	Q03525	211 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SVP26	YHR181W	YPR114W	Q06107	315 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SVP26	YHR181W	POL1	P13382	1468 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SVP26	YHR181W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	SPT14	P32363	452 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	GLC8	P41818	229 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YGL101W	P53144	215 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	GEP7	P53171	287 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	GIM5	Q04493	163 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	CSF1	Q12150	2958 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	GSC2	P40989	1895 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	VPS51	P36116	164 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	APS3	P47064	194 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	SSK2	P53599	1579 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YBR027C	P38220	110 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YER121W	P40076	114 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	CCC1	P47818	322 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	BUD4	P47136	1447 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	SAC3	P46674	1301 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	ATP5	P09457	212 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YEL014C	P39999	101 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	CIN5	P40917	295 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	ORM1	P53224	222 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YNR064C	P53750	290 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	HFA1	P32874	2273 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	DYN1	P36022	4092 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YLR046C	Q12253	270 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	RDI1	Q12434	202 aa		0.86	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	HSP150	P32478	413 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	VAM10	Q08474	114 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	SMC4	Q12267	1418 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	ULS1	Q08562	1619 aa		0.85	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	MAK3	Q03503	176 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	YLR053C	Q12026	108 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.84	□□□□□ -2.27
SVP26	YHR181W	DOP1	Q03921	1698 aa		0.84	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	MRS4	P23500	304 aa		0.83	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	FES1	P38260	290 aa		0.83	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	HHY1	P39982	102 aa		0.83	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YDR476C	Q03362	224 aa		0.83	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YOR1	P53049	1477 aa		0.82	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.82	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
SVP26	YHR181W	FMN1	Q03778	218 aa		0.81	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	RKR1	Q04781	1562 aa		0.81	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	QCR2	P07257	368 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	DLS1	P40366	167 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	GCN2	P15442	1659 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	TRA1	P38811	3744 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	SRB8	P25648	1427 aa		0.8	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	ECM31	P38122	312 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	IPT1	P38954	527 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	FIP1	P45976	327 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YGL193C	P53097	103 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	RCF2	P53721	224 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YPR202W	Q08993	238 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	IML1	P47170	1584 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	PDR10	P51533	1564 aa		0.79	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	USO1	P25386	1790 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	SRP21	P32342	167 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	IRC19	Q07843	230 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	BCK1	Q01389	1478 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SVP26	YHR181W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		0.78	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		0.78	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		0.78	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	SLM6	P38343	150 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	APQ12	P40532	138 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	RFU1	Q08003	200 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	RIB3	Q99258	208 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	SPP41	P38904	1435 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SVP26	YHR181W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29

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