RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W YHR007C-AQ07074 71 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W MDM35O60200 86 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W CCC1P47818 322 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W LIP1Q03579 150 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W DML1Q03652 475 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W FIT2Q08906 153 aa2.68□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YER181CP40097 107 aa2.67□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W UPS3Q04006 179 aa2.67□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W UPS1Q05776 175 aa2.67□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YLR162WQ06235 118 aa2.67□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YPD1Q07688 167 aa2.67□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W HRD1Q08109 551 aa2.67□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W ATG41Q12048 136 aa2.67□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W NSE4P43124 402 aa2.66□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YGR201CP42936 225 aa2.65□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W PAC10P48363 199 aa2.65□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W RBL2P48606 106 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YNR064CP53750 290 aa2.65□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W IGO1P53897 168 aa2.65□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YDR102CQ03864 110 aa2.65□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
YKR047WYKR047W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YHP1Q04116 353 aa2.64□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YMR320WQ04897 101 aa2.64□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W SPC2Q04969 178 aa2.64□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W CSI2Q08054 341 aa2.64□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W TAF2P23255 1407 aa2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W PHO13P19881 312 aa2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W SPT14P32363 452 aa2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W CYC2P38909 366 aa2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W MOB1P40484 314 aa2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W UIP4Q08926 304 aa2.63□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YOL162WP0CF19 215 aa2.62□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W STF2P16965 84 aa2.62□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W GIM4P40005 111 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YPR114WQ06107 315 aa2.62□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W ATG10Q07879 167 aa2.62□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W QCR8P08525 94 aa2.61□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W POP7P38291 140 aa2.61□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YEL067CP39978 195 aa2.61□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YGL204CP53089 101 aa2.61□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YGR042WP53227 271 aa2.61□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W GPA2P10823 449 aa2.6□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W MAK31P23059 88 aa2.6□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YPT31P38555 223 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W MPM1P40364 252 aa2.6□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YML079WQ03629 201 aa2.6□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W RPB7P34087 171 aa2.59□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W HPA3P39979 161 aa2.59□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W YDR366CP87287 132 aa2.59□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W COF1Q03048 143 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W RIB3Q99258 208 aa2.59□□□□□ -1.99
YKR047WYKR047W SPS2P08459 502 aa2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W MRS4P23500 304 aa2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YGL010WP25338 174 aa2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YGR269WP40326 108 aa2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W HYR1P40581 163 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W GPI2P46961 280 aa2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W ELP6Q04868 273 aa2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YMR030W-AQ3E760 96 aa2.58□□□□□ -2
YKR047WYKR047W FLX1P40464 311 aa2.57□□□□□ -2
YKR047WYKR047W HHO1P53551 258 aa2.57□□□□□ -2
YKR047WYKR047W EST3Q03096 181 aa2.57□□□□□ -2
YKR047WYKR047W RCE1Q03530 315 aa2.57□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YBL010CP32788 280 aa2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W PHB1P40961 287 aa2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W CSN9Q03981 162 aa2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YDL241WQ07738 123 aa2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W RRT7Q07829 113 aa2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YDL157CQ12082 118 aa2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YKR047WYKR047W INO4P13902 151 aa2.55□□□□□ -2
YKR047WYKR047W SEN2P16658 377 aa2.55□□□□□ -2
YKR047WYKR047W SRP21P32342 167 aa2.55□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YKR047WYKR047W BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YKR047WYKR047W GEP7P53171 287 aa2.55□□□□□ -2
YKR047WYKR047W MMS22Q06164 1454 aa2.55□□□□□ -2
YKR047WYKR047W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YKR047WYKR047W DDR48P18899 430 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YKR047WYKR047W HSP12P22943 109 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YKR047WYKR047W YGR039WP53225 103 aa2.54□□□□□ -2
YKR047WYKR047W CWC27Q02770 301 aa2.54□□□□□ -2
YKR047WYKR047W RPC19P28000 142 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKR047WYKR047W SUI1P32911 108 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKR047WYKR047W CIN5P40917 295 aa2.53□□□□□ -2
YKR047WYKR047W UBC7Q02159 165 aa2.53□□□□□ -2
YKR047WYKR047W RFU1Q08003 200 aa2.53□□□□□ -2
YKR047WYKR047W AHT1P29589 182 aa2.52□□□□□ -2.01
YKR047WYKR047W MET31Q03081 177 aa2.52□□□□□ -2.01
YKR047WYKR047W YMR252CQ04814 134 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.6 ms