RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PPA2P28239 310 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MRP49P32388 137 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SOR1P35497 357 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPB11P38902 120 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YIL012WP40551 113 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YFR054CP43622 192 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W CIS3P47001 227 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SFH5P47008 294 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W DAD3P69850 94 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SOR2Q07786 357 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W FCY22Q12119 530 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ORT1Q12375 292 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YLR361C-AQ3E795 98 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SEC4P07560 215 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MCK1P21965 375 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SCO1P23833 295 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YAL037WP39728 267 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YGL230CP53074 147 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YMR082CQ04276 118 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W LDS2Q08218 356 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W VPS68Q12016 184 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W GEP5Q12393 293 aa3.24□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W FMP49A0A023PZB3 126 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W STE7P06784 515 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SEC11P15367 167 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W STE18P18852 110 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SPO13P23624 291 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.23□□□□□ -1.89not detected
HCA4YJL033W TOA2P32774 122 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ECM33P38248 429 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YHR130CP38834 111 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W BAT1P38891 393 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TEM1P38987 245 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W XPT1P47165 209 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YLR363W-AQ3E747 85 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ISD11Q6Q560 94 aa3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W INO4P13902 151 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ATP10P18496 279 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SAG1P20840 650 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W AGA2P32781 87 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W OM14P38325 134 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MBB1P39534 108 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W COX15P40086 486 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W OSW5P40219 148 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPR2P40571 144 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YJL213WP40896 331 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W HAC1P41546 238 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YDL186WP48568 277 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W THI74Q04083 370 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W NAT3Q06504 195 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YIR021W-AQ3E739 70 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W HYP2P23301 157 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PRM3Q08931 133 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W AYT1Q12226 474 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ATO3Q12359 275 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W COA2Q3E823 68 aa3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YCR023CP25351 611 aa3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RAD23P32628 398 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W DOG2P38773 246 aa3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W CAB4P53332 305 aa3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MCP1Q12106 302 aa3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa3.21□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SPS18P32572 300 aa3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W WSC4P38739 605 aa3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YER121WP40076 114 aa3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YCH1P42937 148 aa3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YFL065CP43539 102 aa3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W GRE1Q08969 168 aa3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YPR203WQ08994 102 aa3.21□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YCR025CP25352 136 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W GPX1P36014 167 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W MCH2P36032 473 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W SHB17P36136 271 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W PAM17P36147 197 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W KRE9P39005 276 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YOR105WQ08504 108 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W MCT1Q12283 360 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa3.2□□□□□ -1.9
HCA4YJL033W POL2P21951 2222 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.5 ms