RNA–Protein interactions for RNA: YOR248W

YOR248W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOR248W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR248W	YOR248W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YCR023C	P25351	611 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YFL051C	P43552	160 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	TDA4	P47153	279 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	GRX8	Q05926	109 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	PHO85	P17157	305 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	ADE1	P27616	306 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	SBH2	P52871	88 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YGL235W	P53071	178 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	CAF4	P36130	643 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YHL037C	P38733	133 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	NSG1	P38837	291 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	GAL83	Q04739	417 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	UPS1	Q05776	175 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	ATP20	Q12233	115 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	MRPL15	P36523	253 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	RRT1	P38192	103 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	FMP23	P38231	175 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	PGA1	P53896	198 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	SNO1	Q03144	224 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	FIT1	Q04433	528 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	ELP6	Q04868	273 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	CPR5	P35176	225 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	MPM1	P40364	252 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	HHT1	P61830	136 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	VPS28	Q02767	242 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	SHH4	Q06236	168 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	GRE1	Q08969	168 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	ATG41	Q12048	136 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	DAS2	Q12084	232 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	DGK1	Q12382	290 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	AHC2	P25649	128 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	UBC8	P28263	218 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	UGX2	P32772	223 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YKL102C	P34249	101 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YAR064W	P39563	99 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	HOP2	P53187	214 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	NRK1	P53915	240 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	HSP30	P25619	332 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YBL010C	P32788	280 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	ETR1	P38071	380 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	YBR242W	P38331	238 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	NSE4	P43124	402 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	RIM9	Q04734	239 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	AVO2	Q04749	426 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	HFA1	P32874	2273 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR248W	YOR248W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
YOR248W	YOR248W	YKR041W	P36134	250 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	SHG1	P38337	142 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	SOL1	P50278	321 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	DML1	Q03652	475 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YHP1	Q04116	353 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	RFC2	P40348	353 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YIL102C	P40488	101 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	GRX5	Q02784	150 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	GPI17	Q04080	534 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	HRD1	Q08109	551 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	PEX11	Q12462	236 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	NVJ1	P38881	321 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	FMP32	P43557	207 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	RAD6	P06104	172 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	MOB1	P40484	314 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	TIM13	P53299	105 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	CCW12	Q12127	133 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	TRM3	Q07527	1436 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	JIP3	O13555	125 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	CLG1	P35190	452 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	DCV1	P43595	202 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	GIM3	P53900	129 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	FCY1	Q12178	158 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	CSH1	P38287	376 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	YEL028W	P39989	153 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	GRX3	Q03835	250 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YOR248W	YOR248W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YOR248W	YOR248W	ATP7	P30902	174 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YOR248W	YOR248W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35

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