RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	EST3	Q03096	181 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	LCL2	Q08045	131 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	LDS2	Q08218	356 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	VAM10	Q08474	114 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	RTS2	P40962	232 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	GPI2	P46961	280 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	SNX4	P47057	423 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	THI74	Q04083	370 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	KEI1	Q06346	221 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	IZH3	Q07959	543 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	SCP1	Q08873	200 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	PET20	Q99373	253 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL057W	YNL057W	ANB1	P19211	157 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	ZRC1	P20107	442 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	POP5	P28005	173 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	AVT5	P38176	459 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	WSS1	P38838	269 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
YNL057W	YNL057W	MIG3	P39943	394 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YER135C	P40082	130 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YIR035C	P40579	254 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	LCB3	P47013	409 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YAP1802	P53309	568 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	GRX3	Q03835	250 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	SYM1	Q06563	197 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	PAM18	Q07914	168 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	POP8	P38208	133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YJR015W	P47090	510 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	GIM3	P53900	129 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
YNL057W	YNL057W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YCR022C	P25620	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	SEC66	P33754	206 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	RRF1	P38771	230 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	GLE2	P40066	365 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YGR018C	P53211	109 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YGR050C	P53231	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	ERV15	P38312	142 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	LAG1	P38703	411 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YHR122W	P38829	231 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	BDH1	P39714	382 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	MCM22	P47167	239 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	LST7	P53237	242 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	UBC7	Q02159	165 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	RCF1	Q03713	159 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	DCS1	Q06151	350 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	CUP2	P15315	225 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	MIT1	P40002	666 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	HXT14	P42833	540 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	SPO19	Q03029	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	PEX27	Q08580	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	CDC7	P06243	507 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	VMA16	P23968	213 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	CPR4	P25334	318 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YFL067W	P43537	175 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	LOA1	Q06508	300 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	QCR2	P07257	368 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	GPX2	P38143	162 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	CSH1	P38287	376 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	GOS1	P38736	223 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	HPA3	P39979	161 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	IMP2	P46972	177 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	HCH1	P53834	153 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	VPS28	Q02767	242 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	IZH1	Q03419	316 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	SDH7	Q04401	133 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	MGR3	Q04472	501 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YPS3	Q12303	508 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	NKP1	Q12493	238 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL057W	YNL057W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
YNL057W	YNL057W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 113.9 ms