RNA–Protein interactions for RNA: YOR208W

PTP2, Transcript of Nuclear phosphotyrosine-specific phosphatase involved in osmosensing, yeast

Gene PTP2, Length 2,253 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTP2	YOR208W	YEA4	P40004	342 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	GET1	P53192	235 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	COQ1	P18900	473 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	DAD4	P69851	72 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	IKI1	P38874	309 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	PHO85	P17157	305 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	CNB1	P25296	175 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	HPA3	P39979	161 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	NAT3	Q06504	195 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	MRS1	P07266	363 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	TIR1	P10863	254 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YHL037C	P38733	133 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	SER2	P42941	309 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YNL033W	P53964	284 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	FYV12	Q08559	129 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	MDM32	Q12171	622 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	SNF2	P22082	1703 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	TRM5	P38793	499 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	HFA1	P32874	2273 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	MGT1	P26188	188 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	UPS3	Q04006	179 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	BNA7	Q04066	261 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	HTB2	P02294	131 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YFL051C	P43552	160 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	MET31	Q03081	177 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YFL019C	P43576	117 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	NCB2	Q92317	146 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	CBF1	P17106	351 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	STP22	P25604	385 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	ARO7	P32178	256 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	FMP23	P38231	175 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	MPM1	P40364	252 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	RNH1	Q04740	348 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	UGX2	P32772	223 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	MTW1	P39731	289 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	YER134C	P40081	178 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	UBC12	P52491	188 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	VPS71	Q03433	280 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	ARO80	Q04052	950 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	CPR5	P35176	225 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	MRPL15	P36523	253 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	MMS2	P53152	137 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	YNL184C	P53876	108 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	SHH3	Q04487	196 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	ELP6	Q04868	273 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	YBR242W	P38331	238 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	SPC25	P40014	221 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	CUP9	P41817	306 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	YGL235W	P53071	178 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	PGA2	P53903	129 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	DYN3	Q04949	312 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	IGO2	Q9P305	131 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	SNF4	P12904	322 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	STF2	P16965	84 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	ETR1	P38071	380 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	AIM2	P39721	246 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	AVO2	Q04749	426 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	FUS2	Q05670	677 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	UPS1	Q05776	175 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	ATP20	Q12233	115 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	QCR7	P00128	127 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	AHT1	P29589	182 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	FIT1	Q04433	528 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	CCW12	Q12127	133 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	YPK2	P18961	677 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	SFK1	P35735	353 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PTP2	YOR208W	SBH1	P52870	82 aa		0.12	□□□□□ -2.39

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