RNA–Protein interactions for RNA: YMR107W

SPG4, Transcript of Protein required for high temperature survival during stationary phase, yeast

Gene SPG4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPG4	YMR107W	YFL054C	P43549	646 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	BRP1	P53194	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	RPN14	P53196	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	MRX8	Q05473	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	LOA1	Q06508	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	XYL2	Q07993	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	MCH4	Q08268	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	ATO3	Q12359	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	HUT1	Q12520	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	NUP1	P20676	1076 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	MIX23	P38162	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	SNO3	P43544	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YFR054C	P43622	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	TNA1	P53322	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	SNO2	P53823	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	DIA1	P54005	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	ATG39	Q06159	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	VPS68	Q12016	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	ERP4	Q12450	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	INH1	P01097	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	TIR1	P10863	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	PCL1	P24867	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	MRP49	P32388	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	RPB7	P34087	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YBL059W	P34224	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YBR090C	P38253	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	AME1	P38313	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YEL057C	P39983	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	HAC1	P41546	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	RPA43	P46669	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YJR015W	P47090	510 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	TRM9	P49957	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	APS2	Q00381	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	LDS2	Q08218	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	FCY22	Q12119	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	SUT2	Q12286	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	ISA2	Q12425	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPG4	YMR107W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YGL010W	P25338	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	GPX1	P36014	167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	PAM17	P36147	197 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	FRM2	P37261	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YBR184W	P38299	523 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	COX15	P40086	486 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YIL089W	P40500	205 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	DAD3	P69850	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	RLM1	Q12224	676 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	CDC43	P18898	376 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	OCH1	P31755	480 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YBR220C	P38318	560 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	TAE1	P38340	232 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YPS6	P40583	537 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YNL184C	P53876	108 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	NCE101	Q02820	53 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	LPP1	Q04396	274 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	SEI1	Q06058	285 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	POS5	Q06892	414 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	MIM1	Q08176	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	PRM3	Q08931	133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	MCP1	Q12106	302 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	ATG40	Q99325	256 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	COX1	P00401	534 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	DAL82	P21705	255 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	ERV1	P27882	189 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	SRB5	P32585	307 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	RML2	P32611	393 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	EMP70	P32802	667 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	REC114	P32841	428 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPG4	YMR107W	DAD2	P36162	133 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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