RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	APS2	Q00381	147 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	GMC1	Q04399	608 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ZEO1	Q08245	113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YOL160W	Q08321	113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MED11	Q99278	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	GSC2	P40989	1895 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PHO2	P07269	559 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SNF4	P12904	322 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CNB1	P25296	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SNC1	P31109	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
PAM18	YLR008C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PET8	P38921	284 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RPA43	P46669	326 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	GAL83	Q04739	417 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ATG39	Q06159	398 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CNL1	Q06333	122 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YOR342C	Q12182	319 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RPN13	O13563	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YCR100C	P25606	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	TRS65	P32893	560 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SFC1	P33303	322 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	APS1	P35181	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	NAT2	P37293	288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MRP21	P38175	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	TRS20	P38334	175 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	COS8	P38723	381 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YHL044W	P38727	235 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MIT1	P40002	666 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	AYR1	P40471	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SER2	P42941	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	EAF6	P47128	113 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SDT1	P53078	280 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YGL101W	P53144	215 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YGR018C	P53211	109 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YGR219W	P53307	113 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YNL033W	P53964	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CRZ1	P53968	678 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YNL019C	P53975	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	LIP2	Q06005	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SHH4	Q06236	168 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	UIP4	Q08926	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	FRE8	Q12209	686 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ATP14	Q12349	124 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ATG15	P25641	520 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YKL102C	P34249	101 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RCN1	P36054	211 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SKG1	P36169	355 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MRPL39	P36533	70 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MTC6	P38849	526 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AIM2	P39721	246 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PEX17	P40155	199 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	APQ12	P40532	138 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YNL046W	P53956	172 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	HHT1	P61830	136 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	NUP100	Q02629	959 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	TMA23	Q03525	211 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YML018C	Q03730	393 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AIM36	Q03798	255 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MSA1	Q08471	629 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SIR2	P06700	562 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	HAP2	P06774	265 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MSI1	P13712	422 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PTM1	P32857	523 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SNC2	P33328	115 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	ASK1	P35734	292 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PRY2	P36110	329 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SOL2	P37262	315 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AVT5	P38176	459 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	CSH1	P38287	376 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	ARN2	P38724	620 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AVT2	P39981	480 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PAN6	P40459	309 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88

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