RNA–Protein interactions for RNA: YJL007C

YJL007C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YJL007C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL007CYJL007C CWC27Q02770 301 aa0.08□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C YHR007C-AQ07074 71 aa0.08□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C LCL2Q08045 131 aa0.08□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C RAD28Q12021 506 aa0.08□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C TY1B-DR4Q07793 1604 aa0.08□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C CDC10P25342 322 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C POP4P38336 279 aa0.07□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C VMA22P38784 181 aa0.07□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C GVP36P40531 326 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C TSC3Q3E790 80 aa0.07□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C ATG40Q99325 256 aa0.07□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C DNF3Q12674 1656 aa0.07□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C SMC4Q12267 1418 aa0.06□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C YJR149WP47177 404 aa0.06□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C GPM2Q12008 311 aa0.06□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C GDB1Q06625 1536 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C RPL43BP0CX26 92 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C SEC11P15367 167 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C HOC1P47124 396 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C TRM9P49957 279 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C DID2P69771 204 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C YOL160WQ08321 113 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C YOL107WQ12239 342 aa0.05□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C BCK1Q01389 1478 aa0.04□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C IML1P47170 1584 aa0.04□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C YCL042WP25572 119 aa0.04□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C STP22P25604 385 aa0.04□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C TDA8Q6B2U8 126 aa0.04□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C DBF2P22204 572 aa0.03□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C HYR1P40581 163 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C MCM22P47167 239 aa0.03□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C YML108WQ03759 105 aa0.03□□□□□ -2.4
YJL007CYJL007C ESP1Q03018 1630 aa0.02□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C SRB8P25648 1427 aa0.02□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C OM45P16547 393 aa0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YMR252CQ04814 134 aa0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C MCP1Q12106 302 aa0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C SKG1P36169 355 aa0□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YFH7P43591 353 aa0□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YDR274CP87283 123 aa0□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C FIG2P25653 1609 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YSP2Q06681 1438 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.01□□□□□ -2.41not detected
YJL007CYJL007C YBR285WP38354 144 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YEL008WP40001 126 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YEA4P40004 342 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YPL073CP40323 161 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C MDM35O60200 86 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C RTT105P40063 208 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C TY4B-JP47024 1803 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C SEC17P32602 292 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C UGX2P32772 223 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C NTF2P33331 125 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C UTP30P36144 274 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C CUE1P38428 203 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C VTH1P40438 1549 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C VTH2P40890 1549 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL007CYJL007C SPO14P36126 1683 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C BNA6P43619 295 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C YLR460CP54007 376 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C PAM18Q07914 168 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C ATG2P53855 1592 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C YRF1-3P0CX14 1859 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C YRF1-7P0CX15 1859 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C YRF1-6P53819 1859 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C FLO1P32768 1537 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-BQ12491 1770 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C BUD4P47136 1447 aa-0.04□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C BCY1P07278 416 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C PRM8P53174 237 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C ATG31Q12421 196 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-FP0CX63 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-CP25384 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-DR2Q03494 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-OR1Q12113 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-DR1Q12472 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TY2B-OR2Q12501 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C VPS15P22219 1454 aa-0.05□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C CDC28P00546 298 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C MRPL25P23369 157 aa-0.06□□□□□ -2.42
YJL007CYJL007C TVP23P38962 199 aa-0.06□□□□□ -2.42
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