RNA–Protein interactions for RNA: YMR008C

PLB1, Transcript of Phospholipase B (lysophospholipase) involved in lipid metabolism, yeast

Gene PLB1, Length 1,995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PLB1	YMR008C	PKH1	Q03407	766 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	CLC1	P17891	233 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	DJP1	P40564	432 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	ITC1	P53125	1264 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	FCP1	Q03254	732 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	SRS2	P12954	1174 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	PDR18	P53756	1333 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	TEA1	P47988	759 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	RMD1	Q03441	430 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	LAM6	Q08001	693 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	PSH1	Q12161	406 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PLB1	YMR008C	ROX1	P25042	368 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	YGL082W	P53155	381 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	YGL242C	P53066	181 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	MLC1	P53141	149 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	MTC5	Q03897	1148 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	SLA1	P32790	1244 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	MRPS35	P53292	345 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	RIM20	Q12033	661 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	MSB4	Q12317	492 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	MSP1	P28737	362 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	NYV1	Q12255	253 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PLB1	YMR008C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	GYP5	Q12344	894 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	YJL181W	P46987	611 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	NPR2	P39923	615 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	NPA3	P47122	385 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	PIB2	P53191	635 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	SAC3	P46674	1301 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	AI2	P03876	854 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	UBP16	Q02863	499 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	VPS20	Q04272	221 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	EPS1	P40557	701 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PLB1	YMR008C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	HAT1	Q12341	374 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	YNL193W	P53870	558 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	YMR074C	Q04773	145 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	ADR1	P07248	1323 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	HAP5	Q02516	242 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	PBY1	P38254	753 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	BDH2	P39713	417 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	YGL081W	P53156	320 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	HRQ1	Q05549	1077 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	BIK1	P11709	440 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	BUG1	Q12191	341 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLB1	YMR008C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	CWH41	P53008	833 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	SPO22	P40511	975 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	HST1	P53685	503 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	COG8	Q04632	607 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	CTI6	Q08923	506 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	POM152	P39685	1337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	CIR1	P42940	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	RRI2	Q12348	645 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	OPI1	P21957	404 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	UBP1	P25037	809 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	YPR148C	Q06523	435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	BBC1	P47068	1157 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLB1	YMR008C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55

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