RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611640.4

KDM4B-211, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene KDM4B, Length 5,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-211ENST00000611640 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.32■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 TOMM22Q9NS69 142 aa20.32■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.32■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 NCOA2Q15596 1464 aa20.32■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.32■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.32■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.3■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 ROCK1Q13464 1354 aa20.3■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.3■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.29■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 AAMPQ13685 434 aa20.29■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.29■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.29■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.28■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 STAC3Q96MF2 364 aa20.28■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.28■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 TEFQ10587 303 aa20.28■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 PANK1Q8TE04 598 aa20.28■□□□□ 0.84
KDM4B-211ENST00000611640 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.27■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.26■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 BECN2A8MW95 431 aa20.26■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 NFKBIBQ15653 356 aa20.25■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 LNPKQ9C0E8 428 aa20.25■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 TPM3P06753 285 aa20.25■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 GNAI1P63096 354 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 PRDM2Q13029 1718 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 ARAP1Q96P48 1450 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 NECTIN2Q92692 538 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 MCTP1Q6DN14 999 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 NUCB2P80303 420 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-211ENST00000611640 HMOX1P09601 288 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 PPP2R1AP30153 589 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 CDC45O75419 566 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 RNF20Q5VTR2 975 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 CABP2Q9NPB3 220 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
KDM4B-211ENST00000611640 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.812e-7■□□□□ 9.3
KDM4B-211ENST00000611640 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 CFTRP13569 1480 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 MTHFSP49914 203 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 BICD2Q8TD16 824 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 MARCH6O60337 910 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF592Q92610 1267 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 SYNJ1O43426 1573 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 AKNAQ7Z591 1439 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 TPM1P09493 284 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 TRIM29Q14134 588 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.817e-7■■■■□ 19.5
KDM4B-211ENST00000611640 G3V3G9 751 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.11■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 ERC2O15083 957 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 MRE11P49959 708 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 CPLX1O14810 134 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.1■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.09■□□□□ 0.81
KDM4B-211ENST00000611640 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM4B-211ENST00000611640 NCAPD3P42695 1498 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM4B-211ENST00000611640 PDE3AQ14432 1141 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM4B-211ENST00000611640 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM4B-211ENST00000611640 TPM2P07951 284 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM4B-211ENST00000611640 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM4B-211ENST00000611640 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.07■□□□□ 0.8
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