RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	GLI2	P10070	1586 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	TET3	O43151	1660 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	NPAT	Q14207	1427 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPRT	O14522	1441 aa		13.21	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	IDI1	Q13907	227 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPM2	O94759	1503 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	ARX	Q96QS3	562 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP152	O94986	1710 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	PLIN1	O60240	522 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	NOS1	P29475	1434 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC3	O15438	1527 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CTCFL-222	ENST00000609232	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	PANK3	Q9H999	370 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	TESK2	Q96S53	571 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	FBLN1	P23142	703 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF1B	O60333	1816 aa		13.08	□□□□□ -0.31
CTCFL-222	ENST00000609232	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	POGK	Q9P215	609 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.04	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	RALBP1	Q15311	655 aa		13.04	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.04	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.04	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
CTCFL-222	ENST00000609232	MYOM2	P54296	1465 aa		13.02	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.02	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.02	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	NBR1	Q14596	966 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	ERVK-7	P63135	1459 aa		13	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	SYNM	O15061	1565 aa		13	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	NLRP13	Q86W25	1043 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	MSH5	O43196	834 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	PIK3C2G	O75747	1445 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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