RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LTKP29376 864 aa35.09■■■■□ 3.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.09■■■■□ 3.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.07■■■■□ 3.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IQGAP1P46940 1657 aa35.07■■■■□ 3.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.06■■■■□ 3.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPLO60437 1756 aa35.03■■■■□ 3.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IFT172Q9UG01 1749 aa35.01■■■■□ 3.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35■■■■□ 3.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGL3Q3MIN7 710 aa34.97■■■■□ 3.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.96■■■■□ 3.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.87■■■■□ 3.17
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.87■■■■□ 3.17
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.86■■■■□ 3.17
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCANQ96GW7 911 aa34.85■■■■□ 3.17
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DIP2AQ14689 1571 aa34.84■■■■□ 3.17
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYOM2P54296 1465 aa34.84■■■■□ 3.17
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.81■■■■□ 3.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NEUROD1Q13562 356 aa34.8■■■■□ 3.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.79■■■■□ 3.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.78■■■■□ 3.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.77■■■■□ 3.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.76■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.74■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBX22Q9Y458 520 aa34.74■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PIK3C2GO75747 1445 aa34.73■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STAC3Q96MF2 364 aa34.72■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALKQ9UM73 1620 aa34.71■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.7■■■■□ 3.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.7■■■■□ 3.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.69■■■■□ 3.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NWD1Q149M9 1564 aa34.67■■■■□ 3.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LAMC1P11047 1609 aa34.66■■■■□ 3.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PIK3R4Q99570 1358 aa34.66■■■■□ 3.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.65■■■■□ 3.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TONSLQ96HA7 1378 aa34.63■■■■□ 3.13
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CPS1P31327 1500 aa34.63■■■■□ 3.13
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 METP08581 1390 aa34.62■■■■□ 3.13
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNA6P17658 529 aa34.6■■■■□ 3.13
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPRUQ92729 1446 aa34.57■■■■□ 3.13
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.56■■■■□ 3.12
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.55■■■■□ 3.12
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.53■■■■□ 3.12
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.53■■■■□ 3.12
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.5■■■■□ 3.11
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.5■■■■□ 3.11
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGRB1O14514 1584 aa34.47■■■■□ 3.11
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.46■■■■□ 3.11
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CERKQ8TCT0 537 aa34.45■■■■□ 3.11
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.44■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.44■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.44■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.44■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTCH1Q13635 1447 aa34.41■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TECPR2O15040 1411 aa34.39■■■■□ 3.1
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM94Q12767 1356 aa34.38■■■■□ 3.09
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCC11Q96J66 1382 aa34.37■■■■□ 3.09
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STK26Q9P289 416 aa34.36■■■■□ 3.09
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.35■■■■□ 3.09
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.35■■■■□ 3.09
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.33■■■■□ 3.09
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DLC1Q96QB1 1528 aa34.32■■■■□ 3.08
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.31■■■■□ 3.08
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.29■■■■□ 3.08
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.27■■■■□ 3.08
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.25■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIRT1Q96EB6 747 aa34.25■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.24■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MSH6P52701 1360 aa34.23■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C14orf37Q86TY3 774 aa34.22■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.22■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.21■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.2■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.2■■■■□ 3.07
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRAM1Q96QH2 718 aa34.17■■■■□ 3.06
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.16■■■■□ 3.06
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCCP43146 1447 aa34.15■■■■□ 3.06
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POGKQ9P215 609 aa34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms