RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.33■■□□□ 1.33
RABGGTA-205ENST00000558534 CPS1P31327 1500 aa23.33■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 LTKP29376 864 aa23.32■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 CERKQ8TCT0 537 aa23.32■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFYVE9O95405 1425 aa23.32■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.31■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.31■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 BCANQ96GW7 911 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 DIP2AQ14689 1571 aa23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-205ENST00000558534 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXO41Q8TF61 875 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RABGGTA-205ENST00000558534 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXD1Q16676 465 aa23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 TBX22Q9Y458 520 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 PPLO60437 1756 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 PIK3R4Q99570 1358 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 NWD1Q149M9 1564 aa23.14■■□□□ 1.3
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.14■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNA6P17658 529 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 IFT172Q9UG01 1749 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-205ENST00000558534 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.07■■□□□ 1.28
RABGGTA-205ENST00000558534 TOM1O60784 492 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-205ENST00000558534 STAC3Q96MF2 364 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-205ENST00000558534 RGL3Q3MIN7 710 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-205ENST00000558534 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-205ENST00000558534 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-205ENST00000558534 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-205ENST00000558534 MYOM2P54296 1465 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 LAMC1P11047 1609 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ALKQ9UM73 1620 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM94Q12767 1356 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 MSH6P52701 1360 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-205ENST00000558534 PIK3C2GO75747 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 METP08581 1390 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 C14orf37Q86TY3 774 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 PTCH1Q13635 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRUQ92729 1446 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-205ENST00000558534 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DCCP43146 1447 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ATF3P18847 181 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PIP4K2BP78356 416 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-205ENST00000558534 TECPR2O15040 1411 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC11Q96J66 1382 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-205ENST00000558534 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.77■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 SIRT1Q96EB6 747 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 SLAIN2Q9P270 581 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 DLC1Q96QB1 1528 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 STK26Q9P289 416 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 NEUROD1Q13562 356 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRB1O14514 1584 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-205ENST00000558534 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-205ENST00000558534 TONSLQ96HA7 1378 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-205ENST00000558534 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-205ENST00000558534 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-205ENST00000558534 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-205ENST00000558534 HSPA1LP34931 641 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-205ENST00000558534 POGKQ9P215 609 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-205ENST00000558534 MST1RQ04912 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
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