RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.72□□□□□ -0.05
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RABGEF1-208ENST00000510829 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 LAMC1P11047 1609 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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RABGEF1-208ENST00000510829 CEP152O94986 1710 aa14.69□□□□□ -0.06
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RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.68□□□□□ -0.06
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RABGEF1-208ENST00000510829 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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RABGEF1-208ENST00000510829 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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RABGEF1-208ENST00000510829 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCA6Q8N139 1617 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.61□□□□□ -0.07
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RABGEF1-208ENST00000510829 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 PPLO60437 1756 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 IFT172Q9UG01 1749 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CRBNQ96SW2 442 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.45□□□□□ -0.1
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