RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503586.1

PITX1-203, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-203ENST00000503586 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.61■■■■□ 3.13
PITX1-203ENST00000503586 BCANQ96GW7 911 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX1-203ENST00000503586 ZFYVE9O95405 1425 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX1-203ENST00000503586 FOXD1Q16676 465 aa34.58■■■■□ 3.13
PITX1-203ENST00000503586 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
PITX1-203ENST00000503586 CLTCL1P53675 1640 aa34.56■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 CPS1P31327 1500 aa34.54■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.53■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.52■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.51■■■■□ 3.12
PITX1-203ENST00000503586 KIF1BO60333 1816 aa34.46■■■■□ 3.11
PITX1-203ENST00000503586 HRCP23327 699 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX1-203ENST00000503586 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX1-203ENST00000503586 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.41■■■■□ 3.1
PITX1-203ENST00000503586 KCNA6P17658 529 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX1-203ENST00000503586 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.36■■■■□ 3.09
PITX1-203ENST00000503586 TBX22Q9Y458 520 aa34.36■■■■□ 3.09
PITX1-203ENST00000503586 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.35■■■■□ 3.09
PITX1-203ENST00000503586 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.34■■■■□ 3.09
PITX1-203ENST00000503586 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.32■■■■□ 3.08
PITX1-203ENST00000503586 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.3■■■■□ 3.08
PITX1-203ENST00000503586 DIP2AQ14689 1571 aa34.3■■■■□ 3.08
PITX1-203ENST00000503586 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PITX1-203ENST00000503586 RGL3Q3MIN7 710 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX1-203ENST00000503586 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
PITX1-203ENST00000503586 NWD1Q149M9 1564 aa34.25■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 TOM1O60784 492 aa34.25■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.24■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 PIK3R4Q99570 1358 aa34.23■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.22■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.21■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 TMEM94Q12767 1356 aa34.21■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
PITX1-203ENST00000503586 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PITX1-203ENST00000503586 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PITX1-203ENST00000503586 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.18■■■■□ 3.06
PITX1-203ENST00000503586 PPLO60437 1756 aa34.18■■■■□ 3.06
PITX1-203ENST00000503586 PIP4K2BP78356 416 aa34.16■■■■□ 3.06
PITX1-203ENST00000503586 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.15■■■■□ 3.06
PITX1-203ENST00000503586 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PITX1-203ENST00000503586 METP08581 1390 aa34.12■■■■□ 3.05
PITX1-203ENST00000503586 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
PITX1-203ENST00000503586 PTPRUQ92729 1446 aa34.12■■■■□ 3.05
PITX1-203ENST00000503586 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.08■■■■□ 3.05
PITX1-203ENST00000503586 C14orf37Q86TY3 774 aa34.06■■■■□ 3.04
PITX1-203ENST00000503586 ALKQ9UM73 1620 aa34.05■■■■□ 3.04
PITX1-203ENST00000503586 IFT172Q9UG01 1749 aa34.05■■■■□ 3.04
PITX1-203ENST00000503586 MSH6P52701 1360 aa34.05■■■■□ 3.04
PITX1-203ENST00000503586 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.02■■■■□ 3.04
PITX1-203ENST00000503586 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
PITX1-203ENST00000503586 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
PITX1-203ENST00000503586 PIK3C2GO75747 1445 aa33.96■■■■□ 3.03
PITX1-203ENST00000503586 MYOM2P54296 1465 aa33.94■■■■□ 3.02
PITX1-203ENST00000503586 C19orf44Q9H6X5 657 aa33.92■■■■□ 3.02
PITX1-203ENST00000503586 HSPA1LP34931 641 aa33.91■■■■□ 3.02
PITX1-203ENST00000503586 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.9■■■■□ 3.02
PITX1-203ENST00000503586 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.9■■■■□ 3.02
PITX1-203ENST00000503586 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.88■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 ATF3P18847 181 aa33.88■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.87■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 SLAIN2Q9P270 581 aa33.87■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 PTCH1Q13635 1447 aa33.87■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.86■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 STK26Q9P289 416 aa33.85■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.85■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.84■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.83■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 STAC3Q96MF2 364 aa33.83■■■■□ 3.01
PITX1-203ENST00000503586 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.82■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa33.79■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa33.79■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 LAMC1P11047 1609 aa33.79■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 DCCP43146 1447 aa33.79■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa33.77■■■■□ 3
PITX1-203ENST00000503586 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
PITX1-203ENST00000503586 ABCC11Q96J66 1382 aa33.75■■■□□ 2.99
PITX1-203ENST00000503586 TECPR2O15040 1411 aa33.74■■■□□ 2.99
PITX1-203ENST00000503586 NALCNQ8IZF0 1738 aa33.73■■■□□ 2.99
PITX1-203ENST00000503586 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.73■■■□□ 2.99
PITX1-203ENST00000503586 NEUROD1Q13562 356 aa33.7■■■□□ 2.99
PITX1-203ENST00000503586 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.7■■■□□ 2.99
PITX1-203ENST00000503586 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.69■■■□□ 2.98
PITX1-203ENST00000503586 MST1RQ04912 1400 aa33.66■■■□□ 2.98
PITX1-203ENST00000503586 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.63■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 SIRT1Q96EB6 747 aa33.63■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 ADGRB1O14514 1584 aa33.62■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 BRINP3Q76B58 766 aa33.61■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.61■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.59■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 PRAM1Q96QH2 718 aa33.58■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.58■■■□□ 2.97
PITX1-203ENST00000503586 PHLPP1O60346 1717 aa33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.3 ms