RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499326.1

GABPB1-AS1-201, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 717 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLIT1O75093 1534 aa12.8□□□□□ -0.36
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMEM94Q12767 1356 aa12.8□□□□□ -0.36
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.8□□□□□ -0.36
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TSPY4P0CV99 314 aa12.78□□□□□ -0.36
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TSPY10P0CW01 314 aa12.78□□□□□ -0.36
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EID1Q9Y6B2 187 aa12.77□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAP3K1Q13233 1512 aa12.77□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.77□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.77□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KCNA6P17658 529 aa12.75□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CEP152O94986 1710 aa12.74□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.74□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 JCADQ9P266 1359 aa12.73□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.72□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.72□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.72□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.71□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PHLPP1O60346 1717 aa12.71□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PIK3C2BO00750 1634 aa12.71□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TRIM52Q96A61 297 aa12.71□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLAIN2Q9P270 581 aa12.71□□□□□ -0.37
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TET3O43151 1660 aa12.7□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LRP6O75581 1613 aa12.7□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.69□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MSH6P52701 1360 aa12.69□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.67□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 IDI1Q13907 227 aa12.67□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NWD1Q149M9 1564 aa12.67□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.67□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.66□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRR29P0C7W0 189 aa12.66□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 POTEHQ6S545 545 aa12.66□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.66□□□□□ -0.38
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.64□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.64□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RXRBP28702 533 aa12.64□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KIF15Q9NS87 1388 aa12.62□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.62□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 BCANQ96GW7 911 aa12.62□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PROM2Q8N271 834 aa12.61□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.61□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ERBINQ96RT1 1412 aa12.61□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ADGRB3O60242 1522 aa12.59□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SHPRHQ149N8 1683 aa12.59□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.59□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KANK1Q14678 1352 aa12.58□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.58□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NOS1P29475 1434 aa12.58□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa12.57□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 AFF2P51816 1311 aa12.57□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ABCC5O15440 1437 aa12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZFYVE9O95405 1425 aa12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C14orf37Q86TY3 774 aa12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DIP2AQ14689 1571 aa12.56□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RGS12O14924 1447 aa12.55□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C19orf44Q9H6X5 657 aa12.55□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ATF3P18847 181 aa12.54□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 BRINP3Q76B58 766 aa12.54□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TBX22Q9Y458 520 aa12.54□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CHADLQ6NUI6 762 aa12.53□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.53□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.53□□□□□ -0.4
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C8orf37Q96NL8 207 aa12.51□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.51□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DAPK1P53355 1430 aa12.5□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.5□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.5□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.49□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.48□□□□□ -0.41
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms